RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382096.5

VLDLR-201, Transcript of very low density lipoprotein receptor, humanhuman

TSL 5

Gene VLDLR, Length 736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLR-201ENST00000382096 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.35■■■■■ 6.77
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VLDLR-201ENST00000382096 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.73■■■■■ 5.87
VLDLR-201ENST00000382096 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.3■■■■■ 5.48
VLDLR-201ENST00000382096 NACADO15069 1562 aa48.9■■■■■ 5.42
VLDLR-201ENST00000382096 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.82■■■■■ 5.41
VLDLR-201ENST00000382096 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.32■■■■■ 5.33
VLDLR-201ENST00000382096 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.3■■■■■ 5.32
VLDLR-201ENST00000382096 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.16■■■■■ 5.3
VLDLR-201ENST00000382096 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.1■■■■■ 5.29
VLDLR-201ENST00000382096 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.89■■■■■ 5.26
VLDLR-201ENST00000382096 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
VLDLR-201ENST00000382096 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.42■■■■■ 5.18
VLDLR-201ENST00000382096 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.26■■■■■ 5.16
VLDLR-201ENST00000382096 SCRIBQ14160 1630 aa46.99■■■■■ 5.11
VLDLR-201ENST00000382096 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.89■■■■■ 5.1
VLDLR-201ENST00000382096 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.74■■■■■ 5.07
VLDLR-201ENST00000382096 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
VLDLR-201ENST00000382096 NCAPD3P42695 1498 aa45.1■■■■■ 4.81
VLDLR-201ENST00000382096 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.08■■■■■ 4.81
VLDLR-201ENST00000382096 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.91■■■■■ 4.78
VLDLR-201ENST00000382096 CUX2O14529 1486 aa44.86■■■■■ 4.77
VLDLR-201ENST00000382096 SMARCA4P51532 1647 aa44.85■■■■■ 4.77
VLDLR-201ENST00000382096 SMARCA2P51531 1590 aa44.81■■■■■ 4.76
VLDLR-201ENST00000382096 HMGXB3Q12766 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
VLDLR-201ENST00000382096 ERCC6Q03468 1493 aa44.77■■■■■ 4.76
VLDLR-201ENST00000382096 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
VLDLR-201ENST00000382096 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.46■■■■■ 4.71
VLDLR-201ENST00000382096 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
VLDLR-201ENST00000382096 NESP48681 1621 aa44.46■■■■■ 4.71
VLDLR-201ENST00000382096 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.18■■■■■ 4.66
VLDLR-201ENST00000382096 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
VLDLR-201ENST00000382096 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.17■■■■■ 4.66
VLDLR-201ENST00000382096 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44■■■■■ 4.63
VLDLR-201ENST00000382096 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.85■■■■■ 4.61
VLDLR-201ENST00000382096 WIZO95785 1651 aa43.67■■■■■ 4.58
VLDLR-201ENST00000382096 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.67■■■■■ 4.58
VLDLR-201ENST00000382096 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.52■■■■■ 4.56
VLDLR-201ENST00000382096 WDR62O43379 1518 aa43.48■■■■■ 4.55
VLDLR-201ENST00000382096 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.29■■■■■ 4.52
VLDLR-201ENST00000382096 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.19■■■■■ 4.51
VLDLR-201ENST00000382096 CFTRP13569 1480 aa43.15■■■■■ 4.5
VLDLR-201ENST00000382096 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
VLDLR-201ENST00000382096 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
VLDLR-201ENST00000382096 TRIM41Q8WV44 630 aa42.9■■■■■ 4.46
VLDLR-201ENST00000382096 PRDM2Q13029 1718 aa42.89■■■■■ 4.46
VLDLR-201ENST00000382096 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
VLDLR-201ENST00000382096 OSCARQ8IYS5 282 aa42.64■■■■■ 4.42
VLDLR-201ENST00000382096 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.55■■■■■ 4.4
VLDLR-201ENST00000382096 IFT140Q96RY7 1462 aa42.43■■■■■ 4.38
VLDLR-201ENST00000382096 TOPBP1Q92547 1522 aa42.37■■■■■ 4.37
VLDLR-201ENST00000382096 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
VLDLR-201ENST00000382096 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.27■■■■■ 4.36
VLDLR-201ENST00000382096 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.27■■■■■ 4.36
VLDLR-201ENST00000382096 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.27■■■■■ 4.36
VLDLR-201ENST00000382096 ABCC8Q09428 1581 aa42.27■■■■■ 4.36
VLDLR-201ENST00000382096 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.22■■■■■ 4.35
VLDLR-201ENST00000382096 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
VLDLR-201ENST00000382096 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
VLDLR-201ENST00000382096 ARHGEF11O15085 1522 aa42.07■■■■■ 4.33
VLDLR-201ENST00000382096 CHD1O14646 1710 aa42■■■■■ 4.31
VLDLR-201ENST00000382096 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
VLDLR-201ENST00000382096 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
VLDLR-201ENST00000382096 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.71■■■■■ 4.27
VLDLR-201ENST00000382096 WDR97A6NE52 1622 aa41.67■■■■■ 4.26
VLDLR-201ENST00000382096 SOGA1O94964 1423 aa41.65■■■■■ 4.26
VLDLR-201ENST00000382096 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.63■■■■■ 4.25
VLDLR-201ENST00000382096 ARAP1Q96P48 1450 aa41.62■■■■■ 4.25
VLDLR-201ENST00000382096 FBLN2P98095 1184 aa41.6■■■■■ 4.25
VLDLR-201ENST00000382096 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
VLDLR-201ENST00000382096 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
VLDLR-201ENST00000382096 CUX1P39880 1505 aa41.53■■■■■ 4.24
VLDLR-201ENST00000382096 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.53■■■■■ 4.24
VLDLR-201ENST00000382096 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.46■■■■■ 4.23
VLDLR-201ENST00000382096 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
VLDLR-201ENST00000382096 SYNJ1O43426 1573 aa41.39■■■■■ 4.22
VLDLR-201ENST00000382096 GRIN2BQ13224 1484 aa41.37■■■■■ 4.21
VLDLR-201ENST00000382096 PBRM1Q86U86 1689 aa41.32■■■■■ 4.2
VLDLR-201ENST00000382096 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
VLDLR-201ENST00000382096 SYNJ2O15056 1496 aa41.28■■■■■ 4.2
VLDLR-201ENST00000382096 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
VLDLR-201ENST00000382096 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.18■■■■■ 4.18
VLDLR-201ENST00000382096 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.16■■■■■ 4.18
VLDLR-201ENST00000382096 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.13■■■■■ 4.18
VLDLR-201ENST00000382096 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.88■■■■■ 4.13
VLDLR-201ENST00000382096 GRIN2AQ12879 1464 aa40.86■■■■■ 4.13
VLDLR-201ENST00000382096 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
VLDLR-201ENST00000382096 ADAMTS12P58397 1594 aa40.85■■■■■ 4.13
VLDLR-201ENST00000382096 TOP2BQ02880 1626 aa40.83■■■■■ 4.13
VLDLR-201ENST00000382096 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
VLDLR-201ENST00000382096 CEP170Q5SW79 1584 aa40.76■■■■■ 4.12
VLDLR-201ENST00000382096 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.74■■■■■ 4.11
VLDLR-201ENST00000382096 NUP160Q12769 1436 aa40.74■■■■■ 4.11
VLDLR-201ENST00000382096 SHROOM2Q13796 1616 aa40.68■■■■■ 4.1
VLDLR-201ENST00000382096 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.65■■■■■ 4.1
VLDLR-201ENST00000382096 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.63■■■■■ 4.1
VLDLR-201ENST00000382096 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.32■■■■■ 4.05
VLDLR-201ENST00000382096 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
VLDLR-201ENST00000382096 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.3■■■■■ 4.04
VLDLR-201ENST00000382096 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
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