RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.91■■■■□ 3.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.73■■■□□ 2.83
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC9O60706 1549 aa32.41■■■□□ 2.78
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.92■■■□□ 2.54
PGGT1B-202ENST00000379615 NACADO15069 1562 aa30.82■■■□□ 2.52
PGGT1B-202ENST00000379615 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.81■■■□□ 2.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.68■■■□□ 2.5
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.57■■■□□ 2.49
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.46■■■□□ 2.47
PGGT1B-202ENST00000379615 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
PGGT1B-202ENST00000379615 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.09■■■□□ 2.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SCRIBQ14160 1630 aa29.86■■■□□ 2.37
PGGT1B-202ENST00000379615 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.85■■■□□ 2.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.61■■■□□ 2.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.21■■■□□ 2.27
PGGT1B-202ENST00000379615 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.13■■■□□ 2.25
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PGGT1B-202ENST00000379615 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCA4P51532 1647 aa28.58■■■□□ 2.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCA2P51531 1590 aa28.45■■■□□ 2.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NCAPD3P42695 1498 aa28.44■■■□□ 2.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.44■■■□□ 2.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.41■■■□□ 2.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.32■■■□□ 2.12
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGXB3Q12766 1538 aa28.27■■■□□ 2.12
PGGT1B-202ENST00000379615 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PGGT1B-202ENST00000379615 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PGGT1B-202ENST00000379615 WIZO95785 1651 aa28.08■■■□□ 2.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ERCC6Q03468 1493 aa27.93■■■□□ 2.06
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.87■■■□□ 2.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PGGT1B-202ENST00000379615 NESP48681 1621 aa27.84■■■□□ 2.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CUX2O14529 1486 aa27.79■■■□□ 2.04
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.65■■■□□ 2.02
PGGT1B-202ENST00000379615 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.64■■■□□ 2.02
PGGT1B-202ENST00000379615 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.53■■■□□ 2
PGGT1B-202ENST00000379615 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.53■■■□□ 2
PGGT1B-202ENST00000379615 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PGGT1B-202ENST00000379615 CFTRP13569 1480 aa27.46■■□□□ 1.99
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.46■■□□□ 1.99
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.29■■□□□ 1.96
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.25■■□□□ 1.95
PGGT1B-202ENST00000379615 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.18■■□□□ 1.94
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDM2Q13029 1718 aa27.17■■□□□ 1.94
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR62O43379 1518 aa27.06■■□□□ 1.92
PGGT1B-202ENST00000379615 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC8Q09428 1581 aa26.95■■□□□ 1.9
PGGT1B-202ENST00000379615 TOPBP1Q92547 1522 aa26.85■■□□□ 1.89
PGGT1B-202ENST00000379615 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.82■■□□□ 1.88
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM41Q8WV44 630 aa26.81■■□□□ 1.88
PGGT1B-202ENST00000379615 IFT140Q96RY7 1462 aa26.7■■□□□ 1.87
PGGT1B-202ENST00000379615 CUX1P39880 1505 aa26.65■■□□□ 1.86
PGGT1B-202ENST00000379615 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PGGT1B-202ENST00000379615 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
PGGT1B-202ENST00000379615 SOGA1O94964 1423 aa26.57■■□□□ 1.84
PGGT1B-202ENST00000379615 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.57■■□□□ 1.84
PGGT1B-202ENST00000379615 OSCARQ8IYS5 282 aa26.54■■□□□ 1.84
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PGGT1B-202ENST00000379615 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PGGT1B-202ENST00000379615 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.49■■□□□ 1.83
PGGT1B-202ENST00000379615 TOP2BQ02880 1626 aa26.47■■□□□ 1.83
PGGT1B-202ENST00000379615 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.44■■□□□ 1.82
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNJ1O43426 1573 aa26.42■■□□□ 1.82
PGGT1B-202ENST00000379615 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
PGGT1B-202ENST00000379615 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR97A6NE52 1622 aa26.36■■□□□ 1.81
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.34■■□□□ 1.81
PGGT1B-202ENST00000379615 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.3■■□□□ 1.8
PGGT1B-202ENST00000379615 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.3■■□□□ 1.8
PGGT1B-202ENST00000379615 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.3■■□□□ 1.8
PGGT1B-202ENST00000379615 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.25■■□□□ 1.79
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIN2BQ13224 1484 aa26.24■■□□□ 1.79
PGGT1B-202ENST00000379615 CHD1O14646 1710 aa26.19■■□□□ 1.78
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF11O15085 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.16■■□□□ 1.78
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PGGT1B-202ENST00000379615 FBLN2P98095 1184 aa26.15■■□□□ 1.78
PGGT1B-202ENST00000379615 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.14■■□□□ 1.78
PGGT1B-202ENST00000379615 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF27Q86VH2 1401 aa26.08■■□□□ 1.77
PGGT1B-202ENST00000379615 PBRM1Q86U86 1689 aa26.08■■□□□ 1.77
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNJ2O15056 1496 aa26.04■■□□□ 1.76
PGGT1B-202ENST00000379615 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.04■■□□□ 1.76
PGGT1B-202ENST00000379615 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.03■■□□□ 1.76
PGGT1B-202ENST00000379615 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.97■■□□□ 1.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ARAP1Q96P48 1450 aa25.95■■□□□ 1.74
PGGT1B-202ENST00000379615 IGF1RP08069 1367 aa25.93■■□□□ 1.74
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTS12P58397 1594 aa25.91■■□□□ 1.74
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIN2AQ12879 1464 aa25.87■■□□□ 1.73
PGGT1B-202ENST00000379615 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.83■■□□□ 1.73
PGGT1B-202ENST00000379615 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.82■■□□□ 1.72
PGGT1B-202ENST00000379615 CUL7Q14999 1698 aa25.8■■□□□ 1.72
PGGT1B-202ENST00000379615 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.8■■□□□ 1.72
PGGT1B-202ENST00000379615 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP160Q12769 1436 aa25.75■■□□□ 1.71
PGGT1B-202ENST00000379615 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.74■■□□□ 1.71
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP170Q5SW79 1584 aa25.68■■□□□ 1.7
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