RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368168.3

CD1B-201, Transcript of CD1b molecule, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD1B, Length 1,395 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1B-201ENST00000368168 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.52■■■■□ 3.92
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CD1B-201ENST00000368168 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
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CD1B-201ENST00000368168 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.99■■■■□ 3.03
CD1B-201ENST00000368168 NACADO15069 1562 aa33.69■■■□□ 2.98
CD1B-201ENST00000368168 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.65■■■□□ 2.98
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CD1B-201ENST00000368168 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.13■■■□□ 2.89
CD1B-201ENST00000368168 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.1■■■□□ 2.89
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CD1B-201ENST00000368168 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.5■■■□□ 2.79
CD1B-201ENST00000368168 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.41■■■□□ 2.78
CD1B-201ENST00000368168 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.4■■■□□ 2.78
CD1B-201ENST00000368168 SCRIBQ14160 1630 aa32.39■■■□□ 2.78
CD1B-201ENST00000368168 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CD1B-201ENST00000368168 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.53■■■□□ 2.64
CD1B-201ENST00000368168 NCAPD3P42695 1498 aa31.17■■■□□ 2.58
CD1B-201ENST00000368168 CUX2O14529 1486 aa31.06■■■□□ 2.56
CD1B-201ENST00000368168 ERCC6Q03468 1493 aa31.04■■■□□ 2.56
CD1B-201ENST00000368168 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.04■■■□□ 2.56
CD1B-201ENST00000368168 SMARCA2P51531 1590 aa30.87■■■□□ 2.53
CD1B-201ENST00000368168 SMARCA4P51532 1647 aa30.84■■■□□ 2.53
CD1B-201ENST00000368168 HMGXB3Q12766 1538 aa30.82■■■□□ 2.53
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CD1B-201ENST00000368168 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.54■■■□□ 2.48
CD1B-201ENST00000368168 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.46■■■□□ 2.47
CD1B-201ENST00000368168 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
CD1B-201ENST00000368168 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.44■■■□□ 2.46
CD1B-201ENST00000368168 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.36■■■□□ 2.45
CD1B-201ENST00000368168 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.27■■■□□ 2.44
CD1B-201ENST00000368168 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.23■■■□□ 2.43
CD1B-201ENST00000368168 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.08■■■□□ 2.41
CD1B-201ENST00000368168 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CD1B-201ENST00000368168 TRIM41Q8WV44 630 aa30.03■■■□□ 2.4
CD1B-201ENST00000368168 WIZO95785 1651 aa30.03■■■□□ 2.4
CD1B-201ENST00000368168 WDR62O43379 1518 aa29.99■■■□□ 2.39
CD1B-201ENST00000368168 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.9■■■□□ 2.38
CD1B-201ENST00000368168 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.87■■■□□ 2.37
CD1B-201ENST00000368168 CFTRP13569 1480 aa29.79■■■□□ 2.36
CD1B-201ENST00000368168 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CD1B-201ENST00000368168 OSCARQ8IYS5 282 aa29.7■■■□□ 2.35
CD1B-201ENST00000368168 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CD1B-201ENST00000368168 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
CD1B-201ENST00000368168 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.37■■■□□ 2.29
CD1B-201ENST00000368168 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CD1B-201ENST00000368168 IFT140Q96RY7 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
CD1B-201ENST00000368168 PRDM2Q13029 1718 aa29.27■■■□□ 2.28
CD1B-201ENST00000368168 TOPBP1Q92547 1522 aa29.25■■■□□ 2.27
CD1B-201ENST00000368168 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.23■■■□□ 2.27
CD1B-201ENST00000368168 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.23■■■□□ 2.27
CD1B-201ENST00000368168 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.23■■■□□ 2.27
CD1B-201ENST00000368168 ABCC8Q09428 1581 aa29.14■■■□□ 2.26
CD1B-201ENST00000368168 ARHGEF11O15085 1522 aa29.13■■■□□ 2.25
CD1B-201ENST00000368168 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CD1B-201ENST00000368168 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.07■■■□□ 2.24
CD1B-201ENST00000368168 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
CD1B-201ENST00000368168 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.06■■■□□ 2.24
CD1B-201ENST00000368168 FBLN2P98095 1184 aa28.99■■■□□ 2.23
CD1B-201ENST00000368168 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CD1B-201ENST00000368168 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CD1B-201ENST00000368168 CHD1O14646 1710 aa28.88■■■□□ 2.21
CD1B-201ENST00000368168 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.88■■■□□ 2.21
CD1B-201ENST00000368168 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CD1B-201ENST00000368168 ARAP1Q96P48 1450 aa28.85■■■□□ 2.21
CD1B-201ENST00000368168 SOGA1O94964 1423 aa28.84■■■□□ 2.21
CD1B-201ENST00000368168 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CD1B-201ENST00000368168 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.7■■■□□ 2.19
CD1B-201ENST00000368168 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.7■■■□□ 2.19
CD1B-201ENST00000368168 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CD1B-201ENST00000368168 CUX1P39880 1505 aa28.63■■■□□ 2.17
CD1B-201ENST00000368168 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.6■■■□□ 2.17
CD1B-201ENST00000368168 WDR97A6NE52 1622 aa28.59■■■□□ 2.17
CD1B-201ENST00000368168 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CD1B-201ENST00000368168 GRIN2BQ13224 1484 aa28.58■■■□□ 2.17
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CD1B-201ENST00000368168 FOXD1Q16676 465 aa28.48■■■□□ 2.15
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CD1B-201ENST00000368168 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.28■■■□□ 2.12
CD1B-201ENST00000368168 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
CD1B-201ENST00000368168 GRIN2AQ12879 1464 aa28.21■■■□□ 2.11
CD1B-201ENST00000368168 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.18■■■□□ 2.1
CD1B-201ENST00000368168 NUP160Q12769 1436 aa28.13■■■□□ 2.09
CD1B-201ENST00000368168 CEP170Q5SW79 1584 aa28.1■■■□□ 2.09
CD1B-201ENST00000368168 ADAMTS12P58397 1594 aa28.1■■■□□ 2.09
CD1B-201ENST00000368168 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.08■■■□□ 2.09
CD1B-201ENST00000368168 TOP2BQ02880 1626 aa28.03■■■□□ 2.08
CD1B-201ENST00000368168 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28■■■□□ 2.07
CD1B-201ENST00000368168 SHROOM2Q13796 1616 aa27.97■■■□□ 2.07
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