RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366678.4

NUP133-202, Transcript of nucleoporin 133, humanhuman

TSL 5

Gene NUP133, Length 779 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133-202ENST00000366678 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.93■■■■■ 4.46
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NUP133-202ENST00000366678 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.58■■■■□ 3.45
NUP133-202ENST00000366678 NACADO15069 1562 aa36.39■■■■□ 3.42
NUP133-202ENST00000366678 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.99■■■■□ 3.35
NUP133-202ENST00000366678 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.95■■■■□ 3.35
NUP133-202ENST00000366678 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.8■■■■□ 3.32
NUP133-202ENST00000366678 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.65■■■■□ 3.3
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NUP133-202ENST00000366678 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.57■■■■□ 3.28
NUP133-202ENST00000366678 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.52■■■■□ 3.28
NUP133-202ENST00000366678 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.47■■■■□ 3.27
NUP133-202ENST00000366678 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.14■■■■□ 3.22
NUP133-202ENST00000366678 SCRIBQ14160 1630 aa35.01■■■■□ 3.19
NUP133-202ENST00000366678 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.62■■■■□ 3.13
NUP133-202ENST00000366678 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
NUP133-202ENST00000366678 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.46■■■■□ 3.11
NUP133-202ENST00000366678 NCAPD3P42695 1498 aa33.55■■■□□ 2.96
NUP133-202ENST00000366678 SMARCA4P51532 1647 aa33.48■■■□□ 2.95
NUP133-202ENST00000366678 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.43■■■□□ 2.94
NUP133-202ENST00000366678 SMARCA2P51531 1590 aa33.41■■■□□ 2.94
NUP133-202ENST00000366678 HMGXB3Q12766 1538 aa33.36■■■□□ 2.93
NUP133-202ENST00000366678 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
NUP133-202ENST00000366678 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.21■■■□□ 2.91
NUP133-202ENST00000366678 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
NUP133-202ENST00000366678 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.04■■■□□ 2.88
NUP133-202ENST00000366678 ERCC6Q03468 1493 aa33.02■■■□□ 2.88
NUP133-202ENST00000366678 CUX2O14529 1486 aa33■■■□□ 2.87
NUP133-202ENST00000366678 NESP48681 1621 aa32.88■■■□□ 2.85
NUP133-202ENST00000366678 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.82■■■□□ 2.84
NUP133-202ENST00000366678 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.71■■■□□ 2.83
NUP133-202ENST00000366678 WIZO95785 1651 aa32.67■■■□□ 2.82
NUP133-202ENST00000366678 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
NUP133-202ENST00000366678 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.56■■■□□ 2.8
NUP133-202ENST00000366678 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.56■■■□□ 2.8
NUP133-202ENST00000366678 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.49■■■□□ 2.79
NUP133-202ENST00000366678 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
NUP133-202ENST00000366678 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
NUP133-202ENST00000366678 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.26■■■□□ 2.75
NUP133-202ENST00000366678 WDR62O43379 1518 aa32.21■■■□□ 2.75
NUP133-202ENST00000366678 CFTRP13569 1480 aa32.18■■■□□ 2.74
NUP133-202ENST00000366678 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.16■■■□□ 2.74
NUP133-202ENST00000366678 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.12■■■□□ 2.73
NUP133-202ENST00000366678 PRDM2Q13029 1718 aa32.02■■■□□ 2.72
NUP133-202ENST00000366678 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.87■■■□□ 2.69
NUP133-202ENST00000366678 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
NUP133-202ENST00000366678 ABCC8Q09428 1581 aa31.56■■■□□ 2.64
NUP133-202ENST00000366678 TOPBP1Q92547 1522 aa31.54■■■□□ 2.64
NUP133-202ENST00000366678 IFT140Q96RY7 1462 aa31.52■■■□□ 2.64
NUP133-202ENST00000366678 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.48■■■□□ 2.63
NUP133-202ENST00000366678 OSCARQ8IYS5 282 aa31.42■■■□□ 2.62
NUP133-202ENST00000366678 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
NUP133-202ENST00000366678 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
NUP133-202ENST00000366678 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
NUP133-202ENST00000366678 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
NUP133-202ENST00000366678 TRIM41Q8WV44 630 aa31.22■■■□□ 2.59
NUP133-202ENST00000366678 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.11■■■□□ 2.579e-12■■■■■ 46
NUP133-202ENST00000366678 WDR97A6NE52 1622 aa31.09■■■□□ 2.57
NUP133-202ENST00000366678 CHD1O14646 1710 aa31.07■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.06■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.06■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.06■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 SOGA1O94964 1423 aa31.06■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 CUX1P39880 1505 aa31.04■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.04■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.03■■■□□ 2.56
NUP133-202ENST00000366678 ARHGEF11O15085 1522 aa30.96■■■□□ 2.55
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NUP133-202ENST00000366678 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
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NUP133-202ENST00000366678 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
NUP133-202ENST00000366678 FBLN2P98095 1184 aa30.81■■■□□ 2.52
NUP133-202ENST00000366678 GRIN2BQ13224 1484 aa30.81■■■□□ 2.52
NUP133-202ENST00000366678 PBRM1Q86U86 1689 aa30.77■■■□□ 2.52
NUP133-202ENST00000366678 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.74■■■□□ 2.51
NUP133-202ENST00000366678 SYNJ1O43426 1573 aa30.71■■■□□ 2.51
NUP133-202ENST00000366678 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.71■■■□□ 2.51
NUP133-202ENST00000366678 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.71■■■□□ 2.51
NUP133-202ENST00000366678 SYNJ2O15056 1496 aa30.7■■■□□ 2.51
NUP133-202ENST00000366678 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.7■■■□□ 2.51
NUP133-202ENST00000366678 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.68■■■□□ 2.5
NUP133-202ENST00000366678 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
NUP133-202ENST00000366678 TOP2BQ02880 1626 aa30.65■■■□□ 2.5
NUP133-202ENST00000366678 ARAP1Q96P48 1450 aa30.64■■■□□ 2.5
NUP133-202ENST00000366678 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
NUP133-202ENST00000366678 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.61■■■□□ 2.49
NUP133-202ENST00000366678 ADAMTS12P58397 1594 aa30.45■■■□□ 2.46
NUP133-202ENST00000366678 GRIN2AQ12879 1464 aa30.42■■■□□ 2.46
NUP133-202ENST00000366678 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.39■■■□□ 2.46
NUP133-202ENST00000366678 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.34■■■□□ 2.45
NUP133-202ENST00000366678 NUP160Q12769 1436 aa30.31■■■□□ 2.44
NUP133-202ENST00000366678 CEP170Q5SW79 1584 aa30.3■■■□□ 2.44
NUP133-202ENST00000366678 SHROOM2Q13796 1616 aa30.23■■■□□ 2.43
NUP133-202ENST00000366678 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
NUP133-202ENST00000366678 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.15■■■□□ 2.42
NUP133-202ENST00000366678 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.02■■■□□ 2.4
NUP133-202ENST00000366678 CUL7Q14999 1698 aa30.01■■■□□ 2.39
NUP133-202ENST00000366678 KIF27Q86VH2 1401 aa29.99■■■□□ 2.39
NUP133-202ENST00000366678 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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