RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319511.6

TMUB2-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB2, Length 2,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-201ENST00000319511 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.03■■□□□ 1.92
TMUB2-201ENST00000319511 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TMUB2-201ENST00000319511 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.41■■□□□ 1.34
TMUB2-201ENST00000319511 MYT1Q01538 1121 aa23.29■■□□□ 1.32
TMUB2-201ENST00000319511 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TMUB2-201ENST00000319511 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.38■■□□□ 1.17
TMUB2-201ENST00000319511 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TMUB2-201ENST00000319511 ABCC9O60706 1549 aa22.3■■□□□ 1.16
TMUB2-201ENST00000319511 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.27■■□□□ 1.16
TMUB2-201ENST00000319511 HRCP23327 699 aa22.09■■□□□ 1.13
TMUB2-201ENST00000319511 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22■■□□□ 1.11
TMUB2-201ENST00000319511 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TMUB2-201ENST00000319511 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
TMUB2-201ENST00000319511 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
TMUB2-201ENST00000319511 NACADO15069 1562 aa21.66■■□□□ 1.06
TMUB2-201ENST00000319511 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TMUB2-201ENST00000319511 SCRIBQ14160 1630 aa21.54■■□□□ 1.04
TMUB2-201ENST00000319511 BCL11AQ9H165 835 aa21.53■■□□□ 1.04
TMUB2-201ENST00000319511 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TMUB2-201ENST00000319511 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.44■■□□□ 1.02
TMUB2-201ENST00000319511 APLP2Q06481 763 aa21.4■■□□□ 1.02
TMUB2-201ENST00000319511 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.39■■□□□ 1.01
TMUB2-201ENST00000319511 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
TMUB2-201ENST00000319511 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TMUB2-201ENST00000319511 SLC24A1O60721 1099 aa21.08■□□□□ 0.96
TMUB2-201ENST00000319511 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.03■□□□□ 0.96
TMUB2-201ENST00000319511 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.99■□□□□ 0.95
TMUB2-201ENST00000319511 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.96■□□□□ 0.95
TMUB2-201ENST00000319511 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.9■□□□□ 0.94
TMUB2-201ENST00000319511 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TMUB2-201ENST00000319511 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
TMUB2-201ENST00000319511 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.923e-6■■■□□ 16
TMUB2-201ENST00000319511 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.8■□□□□ 0.92
TMUB2-201ENST00000319511 WIZO95785 1651 aa20.77■□□□□ 0.92
TMUB2-201ENST00000319511 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.76■□□□□ 0.91
TMUB2-201ENST00000319511 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TMUB2-201ENST00000319511 SMARCA4P51532 1647 aa20.7■□□□□ 0.91
TMUB2-201ENST00000319511 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.67■□□□□ 0.9
TMUB2-201ENST00000319511 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.64■□□□□ 0.89
TMUB2-201ENST00000319511 NEUROD1Q13562 356 aa20.58■□□□□ 0.89
TMUB2-201ENST00000319511 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TMUB2-201ENST00000319511 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TMUB2-201ENST00000319511 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.46■□□□□ 0.87
TMUB2-201ENST00000319511 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.45■□□□□ 0.86
TMUB2-201ENST00000319511 SMARCA2P51531 1590 aa20.4■□□□□ 0.86
TMUB2-201ENST00000319511 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.33■□□□□ 0.85
TMUB2-201ENST00000319511 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMUB2-201ENST00000319511 TRIM41Q8WV44 630 aa20.29■□□□□ 0.84
TMUB2-201ENST00000319511 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.28■□□□□ 0.84
TMUB2-201ENST00000319511 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMUB2-201ENST00000319511 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.22■□□□□ 0.83
TMUB2-201ENST00000319511 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TMUB2-201ENST00000319511 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.16■□□□□ 0.82
TMUB2-201ENST00000319511 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.16■□□□□ 0.82
TMUB2-201ENST00000319511 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TMUB2-201ENST00000319511 ABCC8Q09428 1581 aa20.06■□□□□ 0.8
TMUB2-201ENST00000319511 HMGXB3Q12766 1538 aa20.01■□□□□ 0.79
TMUB2-201ENST00000319511 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TMUB2-201ENST00000319511 NCAPD3P42695 1498 aa19.97■□□□□ 0.79
TMUB2-201ENST00000319511 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.93■□□□□ 0.78
TMUB2-201ENST00000319511 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
TMUB2-201ENST00000319511 PLEKHG5O94827 1062 aa19.81■□□□□ 0.76
TMUB2-201ENST00000319511 EEA1Q15075 1411 aa19.81■□□□□ 0.76
TMUB2-201ENST00000319511 SYNJ1O43426 1573 aa19.8■□□□□ 0.76
TMUB2-201ENST00000319511 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
TMUB2-201ENST00000319511 SOGA1O94964 1423 aa19.74■□□□□ 0.75
TMUB2-201ENST00000319511 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.69■□□□□ 0.74
TMUB2-201ENST00000319511 TOP2BQ02880 1626 aa19.69■□□□□ 0.74
TMUB2-201ENST00000319511 PRDM2Q13029 1718 aa19.67■□□□□ 0.74
TMUB2-201ENST00000319511 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.67■□□□□ 0.74
TMUB2-201ENST00000319511 CFTRP13569 1480 aa19.65■□□□□ 0.74
TMUB2-201ENST00000319511 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.63■□□□□ 0.73
TMUB2-201ENST00000319511 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.59■□□□□ 0.73
TMUB2-201ENST00000319511 KIF21BO75037 1637 aa19.58■□□□□ 0.73
TMUB2-201ENST00000319511 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.58■□□□□ 0.72
TMUB2-201ENST00000319511 GOLGA3Q08378 1498 aa19.56■□□□□ 0.72
TMUB2-201ENST00000319511 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
TMUB2-201ENST00000319511 CUX1P39880 1505 aa19.52■□□□□ 0.72
TMUB2-201ENST00000319511 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.51■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.51■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 CEP162Q5TB80 1403 aa19.49■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.48■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.47■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.46■□□□□ 0.71
TMUB2-201ENST00000319511 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.35■□□□□ 0.69
TMUB2-201ENST00000319511 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
TMUB2-201ENST00000319511 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.33■□□□□ 0.69
TMUB2-201ENST00000319511 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
TMUB2-201ENST00000319511 PRXQ9BXM0 1461 aa19.32■□□□□ 0.68
TMUB2-201ENST00000319511 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.3■□□□□ 0.68
TMUB2-201ENST00000319511 KIF27Q86VH2 1401 aa19.29■□□□□ 0.68
TMUB2-201ENST00000319511 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
TMUB2-201ENST00000319511 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.26■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 ERCC6Q03468 1493 aa19.26■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.23■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 NESP48681 1621 aa19.23■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 CLIP1P30622 1438 aa19.23■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.22■□□□□ 0.67
TMUB2-201ENST00000319511 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.1 ms