RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312511.3

PRM1-201, Transcript of protamine 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRM1, Length 424 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM1-201ENST00000312511 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.65■■■□□ 2.02
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PRM1-201ENST00000312511 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.02■■□□□ 1.44
PRM1-201ENST00000312511 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.81■■□□□ 1.4
PRM1-201ENST00000312511 NACADO15069 1562 aa23.58■■□□□ 1.37
PRM1-201ENST00000312511 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
PRM1-201ENST00000312511 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.5■■□□□ 1.35
PRM1-201ENST00000312511 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.32■■□□□ 1.32
PRM1-201ENST00000312511 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.22■■□□□ 1.31
PRM1-201ENST00000312511 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.14■■□□□ 1.3
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PRM1-201ENST00000312511 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.76■■□□□ 1.23
PRM1-201ENST00000312511 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.74■■□□□ 1.23
PRM1-201ENST00000312511 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.74■■□□□ 1.23
PRM1-201ENST00000312511 SCRIBQ14160 1630 aa22.73■■□□□ 1.23
PRM1-201ENST00000312511 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PRM1-201ENST00000312511 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.16■■□□□ 1.14
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PRM1-201ENST00000312511 ERCC6Q03468 1493 aa21.77■■□□□ 1.07
PRM1-201ENST00000312511 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.73■■□□□ 1.07
PRM1-201ENST00000312511 NESP48681 1621 aa21.64■■□□□ 1.05
PRM1-201ENST00000312511 SMARCA4P51532 1647 aa21.62■■□□□ 1.05
PRM1-201ENST00000312511 HMGXB3Q12766 1538 aa21.6■■□□□ 1.05
PRM1-201ENST00000312511 SMARCA2P51531 1590 aa21.59■■□□□ 1.05
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PRM1-201ENST00000312511 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.39■■□□□ 1.01
PRM1-201ENST00000312511 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.34■■□□□ 1.01
PRM1-201ENST00000312511 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.33■■□□□ 1.01
PRM1-201ENST00000312511 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.29■■□□□ 1
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PRM1-201ENST00000312511 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.14■□□□□ 0.98
PRM1-201ENST00000312511 TRIM41Q8WV44 630 aa21.11■□□□□ 0.97
PRM1-201ENST00000312511 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.09■□□□□ 0.97
PRM1-201ENST00000312511 WIZO95785 1651 aa21.06■□□□□ 0.96
PRM1-201ENST00000312511 WDR62O43379 1518 aa21.04■□□□□ 0.96
PRM1-201ENST00000312511 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.94■□□□□ 0.94
PRM1-201ENST00000312511 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.91■□□□□ 0.94
PRM1-201ENST00000312511 CFTRP13569 1480 aa20.85■□□□□ 0.93
PRM1-201ENST00000312511 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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PRM1-201ENST00000312511 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PRM1-201ENST00000312511 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PRM1-201ENST00000312511 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.56■□□□□ 0.88
PRM1-201ENST00000312511 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.56■□□□□ 0.88
PRM1-201ENST00000312511 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.56■□□□□ 0.88
PRM1-201ENST00000312511 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.55■□□□□ 0.88
PRM1-201ENST00000312511 PRDM2Q13029 1718 aa20.54■□□□□ 0.88
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PRM1-201ENST00000312511 TOPBP1Q92547 1522 aa20.49■□□□□ 0.87
PRM1-201ENST00000312511 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRM1-201ENST00000312511 ARHGEF11O15085 1522 aa20.47■□□□□ 0.87
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PRM1-201ENST00000312511 CHD1O14646 1710 aa20.31■□□□□ 0.84
PRM1-201ENST00000312511 ARAP1Q96P48 1450 aa20.28■□□□□ 0.84
PRM1-201ENST00000312511 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PRM1-201ENST00000312511 FBLN2P98095 1184 aa20.26■□□□□ 0.83
PRM1-201ENST00000312511 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.24■□□□□ 0.83
PRM1-201ENST00000312511 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PRM1-201ENST00000312511 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PRM1-201ENST00000312511 SOGA1O94964 1423 aa20.16■□□□□ 0.82
PRM1-201ENST00000312511 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.13■□□□□ 0.81
PRM1-201ENST00000312511 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.11■□□□□ 0.81
PRM1-201ENST00000312511 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.08■□□□□ 0.81
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PRM1-201ENST00000312511 WDR97A6NE52 1622 aa20.01■□□□□ 0.79
PRM1-201ENST00000312511 SYNJ1O43426 1573 aa20■□□□□ 0.79
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PRM1-201ENST00000312511 SYNJ2O15056 1496 aa19.97■□□□□ 0.79
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PRM1-201ENST00000312511 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.84■□□□□ 0.77
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PRM1-201ENST00000312511 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.83■□□□□ 0.76
PRM1-201ENST00000312511 GRIN2AQ12879 1464 aa19.75■□□□□ 0.75
PRM1-201ENST00000312511 CEP170Q5SW79 1584 aa19.73■□□□□ 0.75
PRM1-201ENST00000312511 ADAMTS12P58397 1594 aa19.71■□□□□ 0.75
PRM1-201ENST00000312511 NUP160Q12769 1436 aa19.71■□□□□ 0.75
PRM1-201ENST00000312511 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.68■□□□□ 0.74
PRM1-201ENST00000312511 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PRM1-201ENST00000312511 SHROOM2Q13796 1616 aa19.63■□□□□ 0.73
PRM1-201ENST00000312511 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.63■□□□□ 0.73
PRM1-201ENST00000312511 TOP2BQ02880 1626 aa19.62■□□□□ 0.73
PRM1-201ENST00000312511 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.61■□□□□ 0.73
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PRM1-201ENST00000312511 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.55■□□□□ 0.72
PRM1-201ENST00000312511 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PRM1-201ENST00000312511 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.53■□□□□ 0.72
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