RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301395.7

GGT6-201, Transcript of gamma-glutamyltransferase 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGT6, Length 2,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGT6-201ENST00000301395 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.66■■■□□ 2.82
GGT6-201ENST00000301395 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.43■■■□□ 2.14
GGT6-201ENST00000301395 ABCC9O60706 1549 aa27.67■■■□□ 2.02
GGT6-201ENST00000301395 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.53■■■□□ 2
GGT6-201ENST00000301395 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GGT6-201ENST00000301395 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.89■■□□□ 1.9
GGT6-201ENST00000301395 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.73■■□□□ 1.87
GGT6-201ENST00000301395 NACADO15069 1562 aa26.59■■□□□ 1.85
GGT6-201ENST00000301395 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
GGT6-201ENST00000301395 SCRIBQ14160 1630 aa26.5■■□□□ 1.83
GGT6-201ENST00000301395 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.47■■□□□ 1.83
GGT6-201ENST00000301395 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.22■■□□□ 1.79
GGT6-201ENST00000301395 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
GGT6-201ENST00000301395 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.92■■□□□ 1.74
GGT6-201ENST00000301395 HRCP23327 699 aa25.7■■□□□ 1.7
GGT6-201ENST00000301395 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GGT6-201ENST00000301395 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.67■■□□□ 1.7
GGT6-201ENST00000301395 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.4■■□□□ 1.66
GGT6-201ENST00000301395 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.39■■□□□ 1.65
GGT6-201ENST00000301395 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GGT6-201ENST00000301395 SMARCA4P51532 1647 aa25.2■■□□□ 1.62
GGT6-201ENST00000301395 WIZO95785 1651 aa25.2■■□□□ 1.62
GGT6-201ENST00000301395 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GGT6-201ENST00000301395 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GGT6-201ENST00000301395 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.11■■□□□ 1.61
GGT6-201ENST00000301395 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.93■■□□□ 1.58
GGT6-201ENST00000301395 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.9■■□□□ 1.58
GGT6-201ENST00000301395 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.89■■□□□ 1.58
GGT6-201ENST00000301395 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GGT6-201ENST00000301395 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.74■■□□□ 1.55
GGT6-201ENST00000301395 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GGT6-201ENST00000301395 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GGT6-201ENST00000301395 SMARCA2P51531 1590 aa24.7■■□□□ 1.54
GGT6-201ENST00000301395 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GGT6-201ENST00000301395 NCAPD3P42695 1498 aa24.62■■□□□ 1.53
GGT6-201ENST00000301395 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GGT6-201ENST00000301395 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GGT6-201ENST00000301395 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.59■■□□□ 1.53
GGT6-201ENST00000301395 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.5■■□□□ 1.51
GGT6-201ENST00000301395 HMGXB3Q12766 1538 aa24.49■■□□□ 1.51
GGT6-201ENST00000301395 NESP48681 1621 aa24.24■■□□□ 1.47
GGT6-201ENST00000301395 ABCC8Q09428 1581 aa24.12■■□□□ 1.45
GGT6-201ENST00000301395 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.04■■□□□ 1.44
GGT6-201ENST00000301395 TRIM41Q8WV44 630 aa24.04■■□□□ 1.44
GGT6-201ENST00000301395 CFTRP13569 1480 aa24.03■■□□□ 1.44
GGT6-201ENST00000301395 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GGT6-201ENST00000301395 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.83■■□□□ 1.41
GGT6-201ENST00000301395 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.81■■□□□ 1.4
GGT6-201ENST00000301395 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.81■■□□□ 1.4
GGT6-201ENST00000301395 SYNJ1O43426 1573 aa23.8■■□□□ 1.4
GGT6-201ENST00000301395 PRDM2Q13029 1718 aa23.79■■□□□ 1.4
GGT6-201ENST00000301395 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
GGT6-201ENST00000301395 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
GGT6-201ENST00000301395 CUX1P39880 1505 aa23.72■■□□□ 1.39
GGT6-201ENST00000301395 MYT1Q01538 1121 aa23.69■■□□□ 1.38
GGT6-201ENST00000301395 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.68■■□□□ 1.38
GGT6-201ENST00000301395 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.66■■□□□ 1.38
GGT6-201ENST00000301395 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.66■■□□□ 1.38
GGT6-201ENST00000301395 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
GGT6-201ENST00000301395 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
GGT6-201ENST00000301395 ERCC6Q03468 1493 aa23.61■■□□□ 1.37
GGT6-201ENST00000301395 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.59■■□□□ 1.37
GGT6-201ENST00000301395 SOGA1O94964 1423 aa23.57■■□□□ 1.36
GGT6-201ENST00000301395 TOP2BQ02880 1626 aa23.56■■□□□ 1.36
GGT6-201ENST00000301395 TOPBP1Q92547 1522 aa23.54■■□□□ 1.36
GGT6-201ENST00000301395 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
GGT6-201ENST00000301395 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.51■■□□□ 1.35
GGT6-201ENST00000301395 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.5■■□□□ 1.35
GGT6-201ENST00000301395 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.5■■□□□ 1.35
GGT6-201ENST00000301395 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
GGT6-201ENST00000301395 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.45■■□□□ 1.34
GGT6-201ENST00000301395 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.43■■□□□ 1.34
GGT6-201ENST00000301395 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GGT6-201ENST00000301395 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GGT6-201ENST00000301395 NEUROD1Q13562 356 aa23.4■■□□□ 1.34
GGT6-201ENST00000301395 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GGT6-201ENST00000301395 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GGT6-201ENST00000301395 CUX2O14529 1486 aa23.31■■□□□ 1.32
GGT6-201ENST00000301395 WDR62O43379 1518 aa23.3■■□□□ 1.32
GGT6-201ENST00000301395 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GGT6-201ENST00000301395 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.27■■□□□ 1.32
GGT6-201ENST00000301395 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GGT6-201ENST00000301395 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.31
GGT6-201ENST00000301395 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
GGT6-201ENST00000301395 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.19■■□□□ 1.3
GGT6-201ENST00000301395 EEA1Q15075 1411 aa23.18■■□□□ 1.3
GGT6-201ENST00000301395 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.16■■□□□ 1.3
GGT6-201ENST00000301395 CEP162Q5TB80 1403 aa23.15■■□□□ 1.3
GGT6-201ENST00000301395 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.14■■□□□ 1.3
GGT6-201ENST00000301395 WDR97A6NE52 1622 aa23.13■■□□□ 1.29
GGT6-201ENST00000301395 KIF27Q86VH2 1401 aa23.12■■□□□ 1.29
GGT6-201ENST00000301395 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GGT6-201ENST00000301395 IGF1RP08069 1367 aa23.08■■□□□ 1.29
GGT6-201ENST00000301395 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GGT6-201ENST00000301395 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.04■■□□□ 1.28
GGT6-201ENST00000301395 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.04■■□□□ 1.28
GGT6-201ENST00000301395 IFT140Q96RY7 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
GGT6-201ENST00000301395 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.02■■□□□ 1.28
GGT6-201ENST00000301395 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GGT6-201ENST00000301395 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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