RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276602.10

TERF1-201, Transcript of telomeric repeat binding factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TERF1, Length 3,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1-201ENST00000276602 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.78■■■□□ 2.36
TERF1-201ENST00000276602 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.39■■□□□ 1.82
TERF1-201ENST00000276602 HRCP23327 699 aa26.3■■□□□ 1.8
TERF1-201ENST00000276602 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TERF1-201ENST00000276602 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.9■■□□□ 1.74
TERF1-201ENST00000276602 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.89■■□□□ 1.73
TERF1-201ENST00000276602 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TERF1-201ENST00000276602 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.75■■□□□ 1.71
TERF1-201ENST00000276602 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TERF1-201ENST00000276602 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.2■■□□□ 1.63
TERF1-201ENST00000276602 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.2■■□□□ 1.63
TERF1-201ENST00000276602 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TERF1-201ENST00000276602 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TERF1-201ENST00000276602 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.96■■□□□ 1.59
TERF1-201ENST00000276602 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.85■■□□□ 1.57
TERF1-201ENST00000276602 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TERF1-201ENST00000276602 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TERF1-201ENST00000276602 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TERF1-201ENST00000276602 TRIM41Q8WV44 630 aa24.25■■□□□ 1.47
TERF1-201ENST00000276602 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TERF1-201ENST00000276602 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.23■■□□□ 1.47
TERF1-201ENST00000276602 NEUROD1Q13562 356 aa24.22■■□□□ 1.47
TERF1-201ENST00000276602 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.06■■□□□ 1.44
TERF1-201ENST00000276602 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TERF1-201ENST00000276602 ABCC9O60706 1549 aa24.01■■□□□ 1.43
TERF1-201ENST00000276602 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
TERF1-201ENST00000276602 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TERF1-201ENST00000276602 MYT1Q01538 1121 aa23.94■■□□□ 1.42
TERF1-201ENST00000276602 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TERF1-201ENST00000276602 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TERF1-201ENST00000276602 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.86■■□□□ 1.41
TERF1-201ENST00000276602 SCRIBQ14160 1630 aa23.64■■□□□ 1.38
TERF1-201ENST00000276602 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TERF1-201ENST00000276602 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TERF1-201ENST00000276602 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TERF1-201ENST00000276602 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.37■■□□□ 1.33
TERF1-201ENST00000276602 MIER1Q8N108 512 aa23.35■■□□□ 1.33
TERF1-201ENST00000276602 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.3■■□□□ 1.32
TERF1-201ENST00000276602 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
TERF1-201ENST00000276602 CEP162Q5TB80 1403 aa23.22■■□□□ 1.31
TERF1-201ENST00000276602 WIZO95785 1651 aa23.22■■□□□ 1.31
TERF1-201ENST00000276602 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.1■■□□□ 1.29
TERF1-201ENST00000276602 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TERF1-201ENST00000276602 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TERF1-201ENST00000276602 ABCC8Q09428 1581 aa23.07■■□□□ 1.28
TERF1-201ENST00000276602 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.05■■□□□ 1.28
TERF1-201ENST00000276602 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TERF1-201ENST00000276602 SOGA1O94964 1423 aa23.04■■□□□ 1.28
TERF1-201ENST00000276602 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TERF1-201ENST00000276602 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.94■■□□□ 1.26
TERF1-201ENST00000276602 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TERF1-201ENST00000276602 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.91■■□□□ 1.26
TERF1-201ENST00000276602 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.79■■□□□ 1.24
TERF1-201ENST00000276602 NACADO15069 1562 aa22.76■■□□□ 1.23
TERF1-201ENST00000276602 GOLGA3Q08378 1498 aa22.76■■□□□ 1.23
TERF1-201ENST00000276602 EEA1Q15075 1411 aa22.75■■□□□ 1.23
TERF1-201ENST00000276602 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.74■■□□□ 1.23
TERF1-201ENST00000276602 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.73■■□□□ 1.23
TERF1-201ENST00000276602 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TERF1-201ENST00000276602 SMARCA2P51531 1590 aa22.68■■□□□ 1.22
TERF1-201ENST00000276602 CLIP1P30622 1438 aa22.62■■□□□ 1.21
TERF1-201ENST00000276602 APLP2Q06481 763 aa22.61■■□□□ 1.21
TERF1-201ENST00000276602 BCL11AQ9H165 835 aa22.59■■□□□ 1.21
TERF1-201ENST00000276602 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TERF1-201ENST00000276602 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.57■■□□□ 1.2
TERF1-201ENST00000276602 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TERF1-201ENST00000276602 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.53■■□□□ 1.2
TERF1-201ENST00000276602 KCNH8Q96L42 1107 aa22.52■■□□□ 1.2
TERF1-201ENST00000276602 BCANQ96GW7 911 aa22.51■■□□□ 1.19
TERF1-201ENST00000276602 SMARCA4P51532 1647 aa22.49■■□□□ 1.19
TERF1-201ENST00000276602 KIF21BO75037 1637 aa22.43■■□□□ 1.18
TERF1-201ENST00000276602 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.39■■□□□ 1.17
TERF1-201ENST00000276602 FKBP8Q14318 412 aa22.37■■□□□ 1.17
TERF1-201ENST00000276602 SYNJ1O43426 1573 aa22.34■■□□□ 1.17
TERF1-201ENST00000276602 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TERF1-201ENST00000276602 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TERF1-201ENST00000276602 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TERF1-201ENST00000276602 ITGAEP38570 1179 aa22.2■■□□□ 1.14
TERF1-201ENST00000276602 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TERF1-201ENST00000276602 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TERF1-201ENST00000276602 ARAP1Q96P48 1450 aa22.13■■□□□ 1.13
TERF1-201ENST00000276602 NEFLP07196 543 aa22.12■■□□□ 1.13
TERF1-201ENST00000276602 TRIM52Q96A61 297 aa22.11■■□□□ 1.13
TERF1-201ENST00000276602 MSH5O43196 834 aa22.08■■□□□ 1.13
TERF1-201ENST00000276602 CUX2O14529 1486 aa22.08■■□□□ 1.13
TERF1-201ENST00000276602 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.07■■□□□ 1.12
TERF1-201ENST00000276602 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.04■■□□□ 1.12
TERF1-201ENST00000276602 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.02■■□□□ 1.12
TERF1-201ENST00000276602 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TERF1-201ENST00000276602 MAPKBP1O60336 1514 aa22.02■■□□□ 1.12
TERF1-201ENST00000276602 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TERF1-201ENST00000276602 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
TERF1-201ENST00000276602 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.01■■□□□ 1.11
TERF1-201ENST00000276602 WDR97A6NE52 1622 aa21.98■■□□□ 1.11
TERF1-201ENST00000276602 PRXQ9BXM0 1461 aa21.95■■□□□ 1.11
TERF1-201ENST00000276602 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
TERF1-201ENST00000276602 CCER2I3L3R5 266 aa21.9■■□□□ 1.1
TERF1-201ENST00000276602 ANP32CO43423 234 aa21.9■■□□□ 1.1
TERF1-201ENST00000276602 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.89■■□□□ 1.1
TERF1-201ENST00000276602 TOP2BQ02880 1626 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms