RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261482.8

REEP5-201, Transcript of receptor accessory protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene REEP5, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP5-201ENST00000261482 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.93■■■■■ 7.02
REEP5-201ENST00000261482 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.2■■■■■ 5.95
REEP5-201ENST00000261482 ABCC9O60706 1549 aa50.92■■■■■ 5.74
REEP5-201ENST00000261482 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.28■■■■■ 5.48
REEP5-201ENST00000261482 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.13■■■■■ 5.46
REEP5-201ENST00000261482 NACADO15069 1562 aa49.05■■■■■ 5.44
REEP5-201ENST00000261482 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.05■■■■■ 5.44
REEP5-201ENST00000261482 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.81■■■■■ 5.4
REEP5-201ENST00000261482 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.73■■■■■ 5.39
REEP5-201ENST00000261482 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.9■■■■■ 5.26
REEP5-201ENST00000261482 SCRIBQ14160 1630 aa47.74■■■■■ 5.23
REEP5-201ENST00000261482 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.68■■■■■ 5.22
REEP5-201ENST00000261482 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.54■■■■■ 5.2
REEP5-201ENST00000261482 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
REEP5-201ENST00000261482 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.49■■■■■ 5.03
REEP5-201ENST00000261482 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
REEP5-201ENST00000261482 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.03■■■■■ 4.96
REEP5-201ENST00000261482 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.92■■■■■ 4.94
REEP5-201ENST00000261482 SMARCA4P51532 1647 aa45.66■■■■■ 4.9
REEP5-201ENST00000261482 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
REEP5-201ENST00000261482 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.44■■■■■ 4.86
REEP5-201ENST00000261482 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.36■■■■■ 4.85
REEP5-201ENST00000261482 SMARCA2P51531 1590 aa45.3■■■■■ 4.84
REEP5-201ENST00000261482 NCAPD3P42695 1498 aa45.28■■■■■ 4.84
REEP5-201ENST00000261482 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.16■■■■■ 4.82
REEP5-201ENST00000261482 HMGXB3Q12766 1538 aa45.05■■■■■ 4.8
REEP5-201ENST00000261482 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
REEP5-201ENST00000261482 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
REEP5-201ENST00000261482 WIZO95785 1651 aa44.96■■■■■ 4.79
REEP5-201ENST00000261482 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
REEP5-201ENST00000261482 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
REEP5-201ENST00000261482 NESP48681 1621 aa44.13■■■■■ 4.66
REEP5-201ENST00000261482 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.01■■■■■ 4.64
REEP5-201ENST00000261482 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.01■■■■■ 4.64
REEP5-201ENST00000261482 CADPSQ9ULU8 1353 aa44■■■■■ 4.63
REEP5-201ENST00000261482 ERCC6Q03468 1493 aa43.87■■■■■ 4.61
REEP5-201ENST00000261482 CFTRP13569 1480 aa43.76■■■■■ 4.6
REEP5-201ENST00000261482 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.75■■■■■ 4.59
REEP5-201ENST00000261482 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.57■■■■■ 4.57
REEP5-201ENST00000261482 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.5■■■■■ 4.55
REEP5-201ENST00000261482 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.4■■■■■ 4.54
REEP5-201ENST00000261482 PRDM2Q13029 1718 aa43.4■■■■■ 4.54
REEP5-201ENST00000261482 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
REEP5-201ENST00000261482 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.28■■■■■ 4.52
REEP5-201ENST00000261482 CUX2O14529 1486 aa43.24■■■■■ 4.51
REEP5-201ENST00000261482 WDR62O43379 1518 aa43.09■■■■■ 4.49
REEP5-201ENST00000261482 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
REEP5-201ENST00000261482 TOPBP1Q92547 1522 aa42.82■■■■■ 4.45
REEP5-201ENST00000261482 ABCC8Q09428 1581 aa42.82■■■■■ 4.44
REEP5-201ENST00000261482 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.78■■■■■ 4.44
REEP5-201ENST00000261482 CUX1P39880 1505 aa42.61■■■■■ 4.41
REEP5-201ENST00000261482 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
REEP5-201ENST00000261482 IFT140Q96RY7 1462 aa42.48■■■■■ 4.39
REEP5-201ENST00000261482 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.46■■■■■ 4.399e-6■■■■■ 50.1
REEP5-201ENST00000261482 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.43■■■■■ 4.38
REEP5-201ENST00000261482 SOGA1O94964 1423 aa42.36■■■■■ 4.37
REEP5-201ENST00000261482 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.33■■■■■ 4.37
REEP5-201ENST00000261482 SYNJ1O43426 1573 aa42.32■■■■■ 4.37
REEP5-201ENST00000261482 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
REEP5-201ENST00000261482 TOP2BQ02880 1626 aa42.3■■■■■ 4.36
REEP5-201ENST00000261482 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
REEP5-201ENST00000261482 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.27■■■■■ 4.36
REEP5-201ENST00000261482 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.11■■■■■ 4.33
REEP5-201ENST00000261482 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
REEP5-201ENST00000261482 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
REEP5-201ENST00000261482 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.01■■■■■ 4.32
REEP5-201ENST00000261482 WDR97A6NE52 1622 aa41.98■■■■■ 4.31
REEP5-201ENST00000261482 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.84■■■■■ 4.29
REEP5-201ENST00000261482 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.8■■■■■ 4.28
REEP5-201ENST00000261482 GRIN2BQ13224 1484 aa41.79■■■■■ 4.28
REEP5-201ENST00000261482 TRIM41Q8WV44 630 aa41.74■■■■■ 4.27
REEP5-201ENST00000261482 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.7■■■■■ 4.27
REEP5-201ENST00000261482 PBRM1Q86U86 1689 aa41.68■■■■■ 4.26
REEP5-201ENST00000261482 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.63■■■■■ 4.25
REEP5-201ENST00000261482 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
REEP5-201ENST00000261482 FBLN2P98095 1184 aa41.61■■■■■ 4.25
REEP5-201ENST00000261482 OSCARQ8IYS5 282 aa41.58■■■■■ 4.25
REEP5-201ENST00000261482 KIF27Q86VH2 1401 aa41.56■■■■■ 4.24
REEP5-201ENST00000261482 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
REEP5-201ENST00000261482 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.5■■■■■ 4.23
REEP5-201ENST00000261482 CHD1O14646 1710 aa41.5■■■■■ 4.23
REEP5-201ENST00000261482 SYNJ2O15056 1496 aa41.47■■■■■ 4.23
REEP5-201ENST00000261482 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.41■■■■■ 4.22
REEP5-201ENST00000261482 ADAMTS12P58397 1594 aa41.38■■■■■ 4.22
REEP5-201ENST00000261482 IGF1RP08069 1367 aa41.37■■■■■ 4.21
REEP5-201ENST00000261482 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.36■■■■■ 4.21
REEP5-201ENST00000261482 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.28■■■■■ 4.2
REEP5-201ENST00000261482 GRIN2AQ12879 1464 aa41.25■■■■■ 4.19
REEP5-201ENST00000261482 CUL7Q14999 1698 aa41.17■■■■■ 4.18
REEP5-201ENST00000261482 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.13■■■■■ 4.18
REEP5-201ENST00000261482 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.05■■■■■ 4.16
REEP5-201ENST00000261482 NUP160Q12769 1436 aa41.03■■■■■ 4.16
REEP5-201ENST00000261482 CEP170Q5SW79 1584 aa41.03■■■■■ 4.16
REEP5-201ENST00000261482 EEA1Q15075 1411 aa40.93■■■■■ 4.14
REEP5-201ENST00000261482 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
REEP5-201ENST00000261482 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.91■■■■■ 4.14
REEP5-201ENST00000261482 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.9■■■■■ 4.14
REEP5-201ENST00000261482 ARHGEF11O15085 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
REEP5-201ENST00000261482 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
REEP5-201ENST00000261482 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms