RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000186691.6

Gm28819-201, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Gm28819, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Chic1Q8CBW7 227 aa44.85■■■■■ 4.77
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa43.89■■■■■ 4.62
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Phf23Q8BSN5 401 aa40.32■■■■■ 4.05
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Plppr3Q7TPB0 716 aa38.71■■■■□ 3.79
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Gab3Q8BSM5 595 aa38.52■■■■□ 3.76
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Kcna4Q61423 654 aa35.22■■■■□ 3.23
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Hoxd11P23813 323 aa32.6■■■□□ 2.81
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Fam163aQ8CAA5 168 aa32.59■■■□□ 2.81
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Trap1aP19473 224 aa32.5■■■□□ 2.79
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Dmrt2Q8BG36 561 aa31.46■■■□□ 2.63
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Znf219Q6IQX8 726 aa31.33■■■□□ 2.61
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Chrna2Q91X60 512 aa30.82■■■□□ 2.52
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa30.69■■■□□ 2.5
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Rsph4aQ8BYM7 716 aa30.57■■■□□ 2.48
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Rimbp2Q80U40 1072 aa30.21■■■□□ 2.43
Gm28819-201ENSMUST00000186691 ArsiQ32KI9 573 aa30.05■■■□□ 2.4
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Slc4a1apE9PX68 744 aa30.01■■■□□ 2.39
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa30.01■■■□□ 2.39
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Atf5O70191 283 aa29.97■■■□□ 2.39
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Akt1s1Q9D1F4 257 aa29.64■■■□□ 2.34
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Hs6st3Q9QYK4 470 aa29.61■■■□□ 2.33
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa29.59■■■□□ 2.33
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Slc34a2Q9DBP0 697 aa29.04■■■□□ 2.24
Gm28819-201ENSMUST00000186691 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa28.75■■■□□ 2.19
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Bach1P97302 739 aa28.63■■■□□ 2.17
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Sox12Q04890 314 aa28.37■■■□□ 2.13
Gm28819-201ENSMUST00000186691 WdpcpQ8C456 722 aa27.83■■■□□ 2.05
Gm28819-201ENSMUST00000186691 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa27.41■■□□□ 1.98
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Fam71e1A1L3C1 212 aa27.37■■□□□ 1.97
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Cdca7Q9D0M2 382 aa27.34■■□□□ 1.97
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Nlrp6Q91WS2 869 aa27.23■■□□□ 1.95
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Znf704Q9ERQ3 566 aa27.01■■□□□ 1.91
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Egfem1Q8C088 590 aa26.96■■□□□ 1.91
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa26.96■■□□□ 1.91
Gm28819-201ENSMUST00000186691 G430095P16RikE9Q913 147 aa26.93■■□□□ 1.9
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa26.9■■□□□ 1.9
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ms4a5Q810P8 197 aa26.66■■□□□ 1.86
Gm28819-201ENSMUST00000186691 AcrbpQ3V140 540 aa26.65■■□□□ 1.86
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Pde4cQ3UEI1 686 aa26.61■■□□□ 1.85
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Npm2Q80W85 207 aa26.54■■□□□ 1.84
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ube2uB1AUC4 352 aa26.53■■□□□ 1.84
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Trim41Q5NCC3 630 aa26.46■■□□□ 1.83
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Zbtb12Q9Z150 459 aa26.42■■□□□ 1.82
Gm28819-201ENSMUST00000186691 MyclP10166 368 aa26.41■■□□□ 1.82
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Rnf216P58283 853 aa26.38■■□□□ 1.81
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Gm28819-201ENSMUST00000186691 GapdhsQ64467 440 aa26.32■■□□□ 1.8
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa26.17■■□□□ 1.78
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Prm3Q62100 101 aa26.15■■□□□ 1.78
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Nkx1-1G3UXB3 402 aa25.94■■□□□ 1.74
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Styxl1Q9DAR2 321 aa25.86■■□□□ 1.73
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Tshz2Q68FE9 1030 aa25.75■■□□□ 1.71
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Fbln2P37889 1221 aa25.63■■□□□ 1.69
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
Gm28819-201ENSMUST00000186691 MpndQ3TV65 487 aa25.35■■□□□ 1.65
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Znf703P0CL69 594 aa25.13■■□□□ 1.61
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ildr2B5TVM2 661 aa25.12■■□□□ 1.61
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Kcnn1Q9EQR3 537 aa25.09■■□□□ 1.61
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Skida1Q80YR3 822 aa25.07■■□□□ 1.6
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Prr29B1ARI9 187 aa24.96■■□□□ 1.59
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Pitpnm1O35954 1243 aa24.92■■□□□ 1.58
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Tcf3P15806 651 aa24.83■■□□□ 1.57
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa24.8■■□□□ 1.56
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa24.76■■□□□ 1.55
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Trim35Q8C006 501 aa24.74■■□□□ 1.55
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Pip4p2Q9CZX7 257 aa24.66■■□□□ 1.54
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Kank3Q9Z1P7 791 aa24.66■■□□□ 1.54
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Clcn6O35454 870 aa24.55■■□□□ 1.52
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Lrrc43Q3V0L5 667 aa24.51■■□□□ 1.51
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Jarid2Q62315 1234 aa24.4■■□□□ 1.5
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Cadps2Q8BYR5 1297 aa24.37■■□□□ 1.49
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ecm2Q5FW85 670 aa24.26■■□□□ 1.47
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Nyap1Q6PFX7 833 aa24.25■■□□□ 1.47
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Sra1Q80VJ2 232 aa23.9■■□□□ 1.42
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Gm28819-201ENSMUST00000186691 SnphQ80U23 495 aa23.83■■□□□ 1.41
Gm28819-201ENSMUST00000186691 MycnP03966 462 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Dok7Q18PE0 504 aa23.71■■□□□ 1.39
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa23.61■■□□□ 1.37
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Pde4dQ01063 747 aa23.48■■□□□ 1.35
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Repin1Q5U4E2 545 aa23.48■■□□□ 1.35
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa23.47■■□□□ 1.35
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Fam117bQ3U3E2 584 aa23.42■■□□□ 1.34
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Spock2Q9ER58 423 aa23.39■■□□□ 1.33
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Zbtb7bQ64321 544 aa23.32■■□□□ 1.32
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa23.32■■□□□ 1.32
Gm28819-201ENSMUST00000186691 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Gm28819-201ENSMUST00000186691 CrebzfQ91ZR3 358 aa23.28■■□□□ 1.32
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Atad2Q8CDM1 1040 aa23.17■■□□□ 1.3
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Gm13697A2AK42 830 aa23.12■■□□□ 1.29
Gm28819-201ENSMUST00000186691 Ferd3lQ923Z4 168 aa23.03■■□□□ 1.28
Gm28819-201ENSMUST00000186691 ArntlQ9WTL8 632 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.1 ms