RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520961.1

RBM12B-206, Transcript of RNA binding motif protein 12B, human

TSL 3

Gene RBM12B, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM12B-206	ENST00000520961	PLPP2	O43688	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	CCR9	P51686	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	TFAP4	Q01664	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ASCL2	Q99929	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	PSMD14	O00487	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ZBTB43	O43298	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HRH2	P25021	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	MAP2K2	P36507	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	GALC	P54803	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	LRMP	Q12912	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961		A6NL46	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	FLT1	P17948	1338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	EXTL3	O43909	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF217	O75362	1048 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	CLEC3B	P05452	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	KRT5	P13647	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	PLOD2	O00469	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	NPHP1	O15259	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	MMP15	P51511	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	MED22	Q15528	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ART5	Q96L15	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	GFI1	Q99684	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM12B-206	ENST00000520961	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961		J3QR06	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	GPC4	O75487	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	NFKBIA	P25963	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	EPHA2	P29317	976 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MSH2	P43246	934 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM12B-206	ENST00000520961	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms