RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	NFS1	P25374	497 aa		6.02	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	PET112	P33893	541 aa		6.02	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	ADD66	P36040	267 aa		6.02	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	NSI1	Q12457	570 aa		6.02	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	TAF13	P11747	167 aa		6.01	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	RAD27	P26793	382 aa		6	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	CIT3	P43635	486 aa		6	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	RDH54	P38086	958 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	HDA2	Q06629	674 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	MED7	Q08278	222 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	CYC7	P00045	113 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	GCR1	P07261	785 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	ALT1	P52893	592 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	RCM1	P53972	490 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	RKM2	Q03942	479 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	MAC1	P35192	417 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	VPS53	P47061	822 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	TPP1	Q03796	238 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YKR070W	YKR070W	TRP3	P00937	484 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	OMA1	P36163	345 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	MAD1	P40957	749 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	SIW14	P53965	281 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	ROD1	Q02805	837 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	SVF1	Q05515	481 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	RTT10	Q08924	1013 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	PTC5	Q12511	572 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	TOS1	P38288	455 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	CLN2	P20438	545 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	LIP5	P32875	414 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	MNR2	P35724	969 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	CWC24	P53769	259 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	EAR1	Q03212	550 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	YKR073C	P36153	106 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	ALG3	P38179	458 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	ENT3	P47160	408 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	MKK2	P32491	506 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	YVC1	Q12324	675 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	TRE1	Q08919	783 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	KOG1	P38873	1557 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	CDC34	P14682	295 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	AFG2	P32794	780 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	YJL045W	P47052	634 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YKR070W	YKR070W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	KIP1	P28742	1111 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	YHL012W	P38709	493 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	HXT13	P39924	564 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	GNP1	P48813	663 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	HXT17	P53631	564 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	HXT15	P54854	567 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	SDH1	Q00711	640 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	ADP1	P25371	1049 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	PRO1	P32264	428 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	RER2	P35196	286 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	MCM7	P38132	845 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	MET10	P39692	1035 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	GPB2	P39717	880 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	CNN1	P43618	361 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	GDE1	Q02979	1223 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.87	□□□□□ -1.47	not detected
YKR070W	YKR070W	INP52	P50942	1183 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	SPO21	Q12411	609 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	COQ4	O13525	335 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	MLS1	P30952	554 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	YSC84	P32793	468 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	RGD1	P38339	666 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	PTC7	P38797	343 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	GTS1	P40956	396 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	TYW3	P53177	273 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.86	□□□□□ -1.47	not detected
YKR070W	YKR070W	SSY1	Q03770	852 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	SPO20	Q04359	397 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	PIN2	Q12057	282 aa		5.86	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 162.1 ms