RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
FMP46	YKR049C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	EUG1	P32474	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	MAL33	P38157	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RFC5	P38251	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	FMS1	P50264	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ASE1	P50275	885 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	LIF1	P53150	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SUE1	Q06524	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CSC1	Q06538	782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	UTR4	P32626	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	UGA4	P32837	571 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PAN5	P38787	379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	BDH2	P39713	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	MXR1	P40029	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ENT3	P47160	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PEX14	P53112	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RET3	P53600	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	DCS2	Q12123	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	VPS29	P38759	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ATG1	P53104	897 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	HST1	P53685	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	GIS4	Q04233	774 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	CSM3	Q04659	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SGD1	Q06132	899 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	TIP41	Q12199	356 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
FMP46	YKR049C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	RDS1	P25611	832 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ELM1	P32801	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SEC8	P32855	1065 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SAS3	P34218	831 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	NDT80	P38830	627 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	RTC4	P53850	401 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ERP3	Q12403	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ARP6	Q12509	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ALG1	P16661	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
FMP46	YKR049C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	MBR1	P23493	339 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	IME2	P32581	645 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	RGT1	P32862	1170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SHP1	P34223	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SUL1	P38359	859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ATG32	P40458	529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	DSE4	P53753	1117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ORC4	P54791	529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	HAP5	Q02516	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	DUS4	Q06063	367 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
FMP46	YKR049C	PTC5	Q12511	572 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	TFC4	P33339	1025 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	ISW1	P38144	1129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	DAK2	P43550	591 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	CIT3	P43635	486 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	SLD5	Q03406	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	PHM6	Q05637	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	PEX19	Q07418	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	MET7	Q08645	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FMP46	YKR049C	OXR1	Q08952	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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