RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C MNL2Q12205 849 aa3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SAC3P46674 1301 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MSM1P22438 575 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C RPL5P26321 297 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C MET4P32389 672 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C ESC2Q06340 456 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C OXR1Q08952 273 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YJL181WP46987 611 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C PPT1P53043 513 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C YGL081WP53156 320 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C SYT1Q06836 1226 aa3.59□□□□□ -1.83
DOA4YDR069C NUP159P40477 1460 aa3.59□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C YGR035CP53222 116 aa3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C REV3P14284 1504 aa3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C VPS35P34110 944 aa3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SEC9P40357 651 aa3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C DJP1P40564 432 aa3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RIA1P53893 1110 aa3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C INP2Q03824 705 aa3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PHO4P07270 312 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RAD2P07276 1031 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PIM1P36775 1133 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C EXO84P38261 753 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C INP54Q08227 384 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C YDL176WQ12027 708 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PAN1P32521 1480 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C CDC10P25342 322 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RPT1P33299 467 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C VPS27P40343 622 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RRB1Q04225 511 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C YPR172WQ06608 200 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RAV1P47104 1357 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C IDI1P15496 288 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C BRF1P29056 596 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C MPH1P40562 993 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C CEP3P40969 608 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C STU2P46675 888 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RSC1P53236 928 aa3.57□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SWI1P09547 1314 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C POL1P13382 1468 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C MSC7P38694 644 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PRK1P40494 810 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C OSW7P43611 510 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C HPF1Q05164 967 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C CDC45Q08032 650 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C DPH6Q12429 685 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C VPS5Q92331 675 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C MET5P47169 1442 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C TAF13P11747 167 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C ATE1P16639 503 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C MSH1P25846 959 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RTT107P38850 1070 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C DAK2P43550 591 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C TY4A-JP47023 414 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C KEL2P50090 882 aa3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C FLP1P03870 423 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SEC8P32855 1065 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SHE4P51534 789 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C MEH1Q02205 184 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C LCD1Q04377 747 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SML1Q04964 104 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C YCS4Q06156 1176 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C AUS1Q08409 1394 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C KDX1P36005 433 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C AIM21P40563 679 aa3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C NOP7P53261 605 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C YME2P32843 850 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C RPC37P36121 282 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C MON1P53129 644 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PAP2P53632 584 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C DAL4Q04895 635 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PEX19Q07418 342 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SLX4Q12098 748 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C NKP1Q12493 238 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C GPM1P00950 247 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C FUS1P11710 512 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C HIR2P32480 875 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C PEP7P32609 515 aa3.54□□□□□ -1.84
DOA4YDR069C JJJ3P47138 172 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms