RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.48■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 MSH6P52701 1360 aa24.47■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 KRT24Q2M2I5 525 aa24.47■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 COG3Q96JB2 828 aa24.47■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ILF3-217ENST00000589998 RTL1A6NKG5 1358 aa24.45■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 APBB1O00213 710 aa24.45■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.45■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.45■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 CASC1Q6TDU7 716 aa24.44■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.44■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 C3P01024 1663 aa24.44■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 AKAP12Q02952 1782 aa24.43■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 ST18O60284 1047 aa24.43■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.43■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 ITSN1Q15811 1721 aa24.42■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.42■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 MEIS3Q99687 375 aa24.42■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.42■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.41■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 TPM2P07951 284 aa24.4■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 REC8O95072 547 aa24.4■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.39■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.39■■□□□ 1.5
ILF3-217ENST00000589998 CHL1O00533 1208 aa24.39■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 RBSNQ9H1K0 784 aa24.39■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 PTPRCP08575 1304 aa24.38■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.38■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 GPT2Q8TD30 523 aa24.38■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 KIAA0232Q92628 1395 aa24.38■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.37■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 MCM10Q7L590 875 aa24.37■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 ERC2O15083 957 aa24.37■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.35■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 OFD1O75665 1012 aa24.34■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.34■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 OSCARQ8IYS5 282 aa24.34■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.34■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 METP08581 1390 aa24.33■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.33■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.33■■□□□ 1.49
ILF3-217ENST00000589998 HS1BP3Q53T59 392 aa24.32■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.32■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 HMMRO75330 724 aa24.31■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 SLC4A2P04920 1241 aa24.31■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 PDE1AP54750 535 aa24.31■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.31■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.31■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.29■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 PEAK1Q9H792 1746 aa24.29■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 CRB1P82279 1406 aa24.28■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 NEK4P51957 841 aa24.28■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 TMX3Q96JJ7 454 aa24.28■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.28■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.28■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.27■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 G2E3Q7L622 706 aa24.27■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 SYCE3A1L190 88 aa24.27■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 F6X3S4 739 aa24.27■■□□□ 1.48
ILF3-217ENST00000589998 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.26■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.26■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.25■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.25■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.24■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.23■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.23■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 TECPR2O15040 1411 aa24.23■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.23■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.23■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.23■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.22■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 BRD1O95696 1058 aa24.22■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 MBD3O95983 291 aa24.22■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 MCM2P49736 904 aa24.22■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 TERF1P54274 439 aa24.22■■□□□ 1.47
ILF3-217ENST00000589998 PALD1Q9ULE6 856 aa24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms