RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.72■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 EVC2Q86UK5 1308 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.71■□□□□ 0.75
CS-231ENST00000552222 FBLN1P23142 703 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 HTRA3P83110 453 aa19.7■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.69■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.68■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 LTN1O94822 1766 aa19.68■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.68■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.67■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 LY75O60449 1722 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 NEUROD1Q13562 356 aa19.66■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 IGSF1Q8N6C5 1336 aa19.65■□□□□ 0.74
CS-231ENST00000552222 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 USP31Q70CQ4 1352 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.64■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.63■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 MEGF6O75095 1541 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.61■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 PHF14O94880 888 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.6■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 TMC1Q8TDI8 760 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 IP6K1Q92551 441 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.59■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 USP47Q96K76 1375 aa19.58■□□□□ 0.73
CS-231ENST00000552222 APLP1P51693 650 aa19.58■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 C5P01031 1676 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 TONSLQ96HA7 1378 aa19.55■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 USP54Q70EL1 1684 aa19.54■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 HOXC9P31274 260 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 NBPF4Q96M43 638 aa19.53■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 PALLDQ8WX93 1383 aa19.52■□□□□ 0.72
CS-231ENST00000552222 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 TOMM70O94826 608 aa19.51■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.5■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PP64 1363 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 AK7Q96M32 723 aa19.49■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 C4BP0C0L5 1744 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 A0A0G2JLW4 131 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 AMPHP49418 695 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 BCS1LQ9Y276 419 aa19.48■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 TNS4Q8IZW8 715 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 LINC00116Q8NCU8 138 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 KLRG1Q96E93 195 aa19.47■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 WDR90Q96KV7 1748 aa19.46■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.46■□□□□ 0.71
CS-231ENST00000552222 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 FLAD1Q8NFF5 587 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.45■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 CYP27B1O15528 508 aa19.44■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 MMP10P09238 476 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 PIGBQ92521 554 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 ITPK1Q13572 414 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 JMYQ8N9B5 988 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 DPEP1P16444 411 aa19.41■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 PRELPP51888 382 aa19.41■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 C9orf131Q5VYM1 1079 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-231ENST00000552222 GNPATO15228 680 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 COG3Q96JB2 828 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.39■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 PCNTO95613 3336 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 RRAGCQ9HB90 399 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 FCHSD2O94868 740 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 SSFA2P28290 1259 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 SIK1P57059 783 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 ITGB4P16144 1822 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 KCNA3P22001 575 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-231ENST00000552222 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms