RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521812.1

MEG3-218, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-218ENST00000521812 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.57■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 NSD2O96028 1365 aa22.55■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 LY75O60449 1722 aa22.54■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 NME9Q86XW9 330 aa22.53■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 USP54Q70EL1 1684 aa22.52■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 LTN1O94822 1766 aa22.51■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 KIF3CO14782 793 aa22.5■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.5■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 APLP1P51693 650 aa22.49■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.49■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.48■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 IP6K1Q92551 441 aa22.47■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 USP47Q96K76 1375 aa22.47■■□□□ 1.19
MEG3-218ENST00000521812 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.44■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.42■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.4■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
MEG3-218ENST00000521812 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 MEGF6O75095 1541 aa22.39■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 TOMM70O94826 608 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 C5P01031 1676 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 TMC1Q8TDI8 760 aa22.37■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 HOXC9P31274 260 aa22.35■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.35■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 PALLDQ8WX93 1383 aa22.35■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.34■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 AK7Q96M32 723 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-218ENST00000521812 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 A0A1W2PP64 1363 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 AMPHP49418 695 aa22.31■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.3■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 PHF14O94880 888 aa22.3■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 C4BP0C0L5 1744 aa22.3■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.29■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 SMIM5Q71RC9 77 aa22.29■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 NBPF4Q96M43 638 aa22.29■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.29■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 CAPN15O75808 1086 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 FBLN1P23142 703 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 KLRG1Q96E93 195 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.28■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.27■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 JMYQ8N9B5 988 aa22.27■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.27■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 COG3Q96JB2 828 aa22.27■■□□□ 1.16
MEG3-218ENST00000521812 SSFA2P28290 1259 aa22.26■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.26■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.26■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 WDR90Q96KV7 1748 aa22.25■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.24■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.24■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 HTRA3P83110 453 aa22.24■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 RTL1A6NKG5 1358 aa22.24■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 PRELPP51888 382 aa22.23■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 TNS4Q8IZW8 715 aa22.23■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 BCS1LQ9Y276 419 aa22.22■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.22■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 PCNTO95613 3336 aa22.21■■□□□ 1.15
MEG3-218ENST00000521812 CYP27B1O15528 508 aa22.2■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 MMP10P09238 476 aa22.2■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 TGFB2P61812 414 aa22.2■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.2■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.2■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 FSTL1Q12841 308 aa22.19■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 PIGBQ92521 554 aa22.19■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 A0A0G2JLW4 131 aa22.18■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.18■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 GNPATO15228 680 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 SIK1P57059 783 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.16■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.15■■□□□ 1.14
MEG3-218ENST00000521812 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms