RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-202ENST00000444040 PIK3C2AO00443 1686 aa20■□□□□ 0.79
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SHQ1-202ENST00000444040 NLRP6P59044 892 aa19.94■□□□□ 0.78
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SHQ1-202ENST00000444040 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.82■□□□□ 0.76
SHQ1-202ENST00000444040 USP26Q9BXU7 913 aa19.81■□□□□ 0.76
SHQ1-202ENST00000444040 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
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SHQ1-202ENST00000444040 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
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SHQ1-202ENST00000444040 PDE1AP54750 535 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-202ENST00000444040 SALL3Q9BXA9 1300 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-202ENST00000444040 FSD2A1L4K1 749 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-202ENST00000444040 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-202ENST00000444040 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-202ENST00000444040 NFAT5O94916 1531 aa19.76■□□□□ 0.75
SHQ1-202ENST00000444040 C14orf37Q86TY3 774 aa19.75■□□□□ 0.75
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