RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399201.5

SETD4-202, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-202ENST00000399201 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.37■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 MSH5O43196 834 aa15.37■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.37■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 IFFO2Q5TF58 517 aa15.36■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 USP47Q96K76 1375 aa15.36■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 NEUROD1Q13562 356 aa15.35■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.35■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 CEP350Q5VT06 3117 aa15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 AMPHP49418 695 aa15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 COG3Q96JB2 828 aa15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 C5P01031 1676 aa15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 A0A1W2PP64 1363 aa15.34■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 SLC24A1O60721 1099 aa15.33■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.33■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.33■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.33■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.33■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.32■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.31■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 RTL1A6NKG5 1358 aa15.3■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 HOXC9P31274 260 aa15.3■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 KCNQ4P56696 695 aa15.3■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.3■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.3■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 ATP10DQ9P241 1426 aa15.29■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 NSD2O96028 1365 aa15.29■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.28■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.28■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 MEGF6O75095 1541 aa15.27■□□□□ 0.04
SETD4-202ENST00000399201 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.26■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.26■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 MSL1Q68DK7 614 aa15.26■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 ITGB4P16144 1822 aa15.25■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 C4BP0C0L5 1744 aa15.24■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 AK7Q96M32 723 aa15.24■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 PALLDQ8WX93 1383 aa15.24■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 TONSLQ96HA7 1378 aa15.24■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.23■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 HSPA6P17066 643 aa15.23■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.23■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.21■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.21■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 NBPF4Q96M43 638 aa15.21■□□□□ 0.03
SETD4-202ENST00000399201 ADCY9O60503 1353 aa15.21■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.21■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.19■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.19■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.19■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 INSRP06213 1382 aa15.19■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 FLT4P35916 1363 aa15.19■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.17■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 SSFA2P28290 1259 aa15.17■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.16■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 PHF14O94880 888 aa15.16■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 FBLN1P23142 703 aa15.16■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 TMF1P82094 1093 aa15.15■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 CDCA8Q53HL2 280 aa15.15■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 TESK2Q96S53 571 aa15.15■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.15■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 SPG7Q9UQ90 795 aa15.15■□□□□ 0.02
SETD4-202ENST00000399201 FYB1O15117 783 aa15.14■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.13■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 APLP1P51693 650 aa15.13■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.13■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.12■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 CYP27B1O15528 508 aa15.12■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 SIK1P57059 783 aa15.12■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.12■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.11■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.11■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 GNPATO15228 680 aa15.1■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 PIGBQ92521 554 aa15.1■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.09■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 KIF3CO14782 793 aa15.09■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 TOMM70O94826 608 aa15.09■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 ATP6V1AP38606 617 aa15.09■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 TGFB2P61812 414 aa15.09■□□□□ 0.01
SETD4-202ENST00000399201 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.012e-8■□□□□ 10.4
SETD4-202ENST00000399201 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
SETD4-202ENST00000399201 MMP10P09238 476 aa15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms