RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258062.9

REPS1-201, Transcript of RALBP1 associated Eps domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene REPS1, Length 3,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1-201ENST00000258062 CEP85Q6P2H3 762 aa20.33■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.32■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.32■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 MEIS3Q99687 375 aa20.32■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 ACEP12821 1306 aa20.31■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 SLC4A2P04920 1241 aa20.3■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 MSH6P52701 1360 aa20.3■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 RABEP1Q15276 862 aa20.3■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.29■□□□□ 0.84
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REPS1-201ENST00000258062 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.29■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 SDSP20132 328 aa20.29■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.29■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 RGS12O14924 1447 aa20.29■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 ATP10DQ9P241 1426 aa20.29■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 RTL1A6NKG5 1358 aa20.28■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 PTPRCP08575 1304 aa20.28■□□□□ 0.84
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REPS1-201ENST00000258062 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.28■□□□□ 0.84
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REPS1-201ENST00000258062 TECPR2O15040 1411 aa20.27■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 KIAA0232Q92628 1395 aa20.27■□□□□ 0.84
REPS1-201ENST00000258062 FOXO3O43524 673 aa20.27■□□□□ 0.84
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REPS1-201ENST00000258062 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
REPS1-201ENST00000258062 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.22■□□□□ 0.83
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REPS1-201ENST00000258062 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.22■□□□□ 0.83
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REPS1-201ENST00000258062 AKAP12Q02952 1782 aa20.21■□□□□ 0.83
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REPS1-201ENST00000258062 USP6P35125 1406 aa20.2■□□□□ 0.82
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REPS1-201ENST00000258062 CLCN1P35523 988 aa20.2■□□□□ 0.82
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REPS1-201ENST00000258062 AMPHP49418 695 aa20.17■□□□□ 0.82
REPS1-201ENST00000258062 PDE1AP54750 535 aa20.17■□□□□ 0.82
REPS1-201ENST00000258062 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.17■□□□□ 0.82
REPS1-201ENST00000258062 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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REPS1-201ENST00000258062 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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REPS1-201ENST00000258062 STK31Q9BXU1 1019 aa20.16■□□□□ 0.82
REPS1-201ENST00000258062 GNAI2P04899 355 aa20.16■□□□□ 0.82
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REPS1-201ENST00000258062 ARHGEF10O15013 1369 aa20.15■□□□□ 0.82
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REPS1-201ENST00000258062 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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REPS1-201ENST00000258062 SBNO1A3KN83 1393 aa20.11■□□□□ 0.81
REPS1-201ENST00000258062 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.11■□□□□ 0.81
REPS1-201ENST00000258062 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.11■□□□□ 0.81
REPS1-201ENST00000258062 NEK4P51957 841 aa20.1■□□□□ 0.81
REPS1-201ENST00000258062 AK9Q5TCS8 1911 aa20.1■□□□□ 0.81
REPS1-201ENST00000258062 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.1■□□□□ 0.81
REPS1-201ENST00000258062 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
REPS1-201ENST00000258062 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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