RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 USP31Q70CQ4 1352 aa20.44■□□□□ 0.86
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HOXD3-201ENST00000249440 MCM10Q7L590 875 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD3-201ENST00000249440 EID1Q9Y6B2 187 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD3-201ENST00000249440 PEAK1Q9H792 1746 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD3-201ENST00000249440 CDC45O75419 566 aa20.43■□□□□ 0.86
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HOXD3-201ENST00000249440 KDRP35968 1356 aa20.33■□□□□ 0.85
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HOXD3-201ENST00000249440 PTMSP20962 102 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD3-201ENST00000249440 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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HOXD3-201ENST00000249440 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD3-201ENST00000249440 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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HOXD3-201ENST00000249440 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
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HOXD3-201ENST00000249440 SDSP20132 328 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD3-201ENST00000249440 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.27■□□□□ 0.84
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HOXD3-201ENST00000249440 STK31Q9BXU1 1019 aa20.26■□□□□ 0.83
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HOXD3-201ENST00000249440 MRE11P49959 708 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 F6X3S4 739 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 CACNA1FO60840 1977 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 NLRP6P59044 892 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 GNAI2P04899 355 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD3-201ENST00000249440 REC8O95072 547 aa20.22■□□□□ 0.83
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