RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 USP54Q70EL1 1684 aa25.4■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.39■■□□□ 1.66
VGF-201ENST00000249330 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.39■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF10O15013 1369 aa25.39■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.38■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 MSH6P52701 1360 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 MCM10Q7L590 875 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 IP6K1Q92551 441 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 NFAT5O94916 1531 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.36■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 MBIPQ9NS73 344 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 DCCP43146 1447 aa25.35■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 KDRP35968 1356 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 LTN1O94822 1766 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.34■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
VGF-201ENST00000249330 ZNF853P0CG23 659 aa25.33■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 IFT57Q9NWB7 429 aa25.33■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 GNAI1P63096 354 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 TSPYL6Q8N831 410 aa25.32■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 CFAP44Q96MT7 982 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 KIF1AQ12756 1690 aa25.31■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 NBPF4Q96M43 638 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 RTL1A6NKG5 1358 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 MCM4P33991 863 aa25.3■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.29■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.28■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.27■■□□□ 1.64
VGF-201ENST00000249330 BRINP3Q76B58 766 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 VAMP4O75379 141 aa25.26■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 SLIT3O75094 1523 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.25■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 FSD2A1L4K1 749 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 ARXQ96QS3 562 aa25.24■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 KRT24Q2M2I5 525 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 SLAIN2Q9P270 581 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.23■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 TRIM27P14373 513 aa25.22■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 ALS2Q96Q42 1657 aa25.21■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 CHL1O00533 1208 aa25.21■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.2■■□□□ 1.63
VGF-201ENST00000249330 HSCBQ8IWL3 235 aa25.2■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.2■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 CRB1P82279 1406 aa25.19■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 TRAK2O60296 914 aa25.19■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.18■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.18■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.18■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.18■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.18■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 PXDNQ92626 1479 aa25.18■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.17■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.16■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 IL17REQ8NFR9 667 aa25.15■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.15■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 CHRNA2Q15822 529 aa25.15■■□□□ 1.62
VGF-201ENST00000249330 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 SMC5Q8IY18 1101 aa25.13■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 ZNF428Q96B54 188 aa25.13■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 PANK2Q9BZ23 570 aa25.13■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.13■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 KIF16BQ96L93 1317 aa25.13■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 MRE11P49959 708 aa25.12■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 ERBB3P21860 1342 aa25.11■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 RGPD5Q99666 1765 aa25.11■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 MAP3K5Q99683 1374 aa25.11■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
VGF-201ENST00000249330 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.1■■□□□ 1.61
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