RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Sugp2Q8CH09 1067 aa40.56■■■■■ 4.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pdzd9Q9D9M4 266 aa40.55■■■■■ 4.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gm7361D3Z6R1 267 aa40.48■■■■■ 4.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa40.48■■■■■ 4.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gm1979E9QAN3 267 aa40.48■■■■■ 4.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gm5862K7N5V5 267 aa40.48■■■■■ 4.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gm10220K7N660 267 aa40.48■■■■■ 4.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa40.48■■■■■ 4.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ssfa2Q922B9 1252 aa40.48■■■■■ 4.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ppfibp2O35711 882 aa40.36■■■■■ 4.05
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Nkx2-3P97334 362 aa40.35■■■■■ 4.05
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Col22a1E9Q7P1 1613 aa40.35■■■■■ 4.05
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa40.24■■■■■ 4.03
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Myo5bP21271 1818 aa40.23■■■■■ 4.03
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ggnbp2Q5SV77 696 aa40.22■■■■■ 4.03
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Prim1P20664 417 aa40.21■■■■■ 4.03
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa40.16■■■■■ 4.02
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa40.15■■■■■ 4.02
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Klc3Q91W40 508 aa40.13■■■■■ 4.02
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Sos2Q02384 1333 aa40.13■■■■■ 4.01
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gnai3Q9DC51 354 aa40.12■■■■■ 4.01
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Klhdc4Q921I2 584 aa40.1■■■■■ 4.01
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Vars2Q3U2A8 1060 aa40.09■■■■■ 4.01
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Snapc4Q8BP86 1333 aa39.99■■■■□ 3.99
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pibf1E9Q6K3 756 aa39.99■■■■□ 3.99
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Usp16Q99LG0 825 aa39.99■■■■□ 3.99
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Irx6Q9ER75 438 aa39.99■■■■□ 3.99
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa39.97■■■■□ 3.99
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Dcaf5Q80T85 946 aa39.96■■■■□ 3.99
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