RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	YLR407W	Q06070	228 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	TAH18	Q12181	623 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	MMP1	Q12372	583 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	LTV1	P34078	463 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	FAR11	P53917	953 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	UBP16	Q02863	499 aa		5.77	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
PUS1	YPL212C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
PUS1	YPL212C	SIT4	P20604	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	GSY2	P27472	705 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YJU3	P28321	313 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
PUS1	YPL212C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YJL007C	P47080	104 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
PUS1	YPL212C	NMA111	P53920	997 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	EST2	Q06163	884 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	LAM6	Q08001	693 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	ISU2	Q12056	156 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	HAT1	Q12341	374 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	RGP1	P16664	663 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	BIM1	P40013	344 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	EPL1	P43572	832 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YDL129W	Q07555	291 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	NCR1	Q12200	1170 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	ADR1	P07248	1323 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	CTH1	P47976	325 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	ALD3	P54114	506 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	WAR1	Q03631	944 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YCG1	Q06680	1035 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	LAM4	P38800	1345 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	CBP3	P21560	335 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	ATG32	P40458	529 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	FYV10	P40492	516 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	IRC8	P47046	822 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	APP1	P53933	587 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	ECM23	Q02710	187 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	SRC1	Q03707	834 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YDR344C	Q05510	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	RAD59	Q12223	238 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	POM152	P39685	1337 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	PET111	P08468	800 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	NPL4	P33755	580 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	RER2	P35196	286 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	GEF1	P37020	779 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YBL036C	P38197	257 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	PDR1	P12383	1068 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	MRC1	P25588	1096 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	BIO2	P32451	375 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	SAP190	P36123	1033 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	DOT5	P40553	215 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	IOC3	P43596	787 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	OSW7	P43611	510 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YJL181W	P46987	611 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	NYV1	Q12255	253 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	SLY41	P22215	453 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	NUD1	P32336	851 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	YKR075C	P36155	307 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	SAP30	P38429	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	CIN4	P39110	191 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	VPS75	P53853	264 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	KAR5	Q04746	504 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	COG4	Q06096	861 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUS1	YPL212C	CYB2	P00175	591 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	KEX2	P13134	814 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	PET123	P17558	318 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	CDC15	P27636	974 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	ASF1	P32447	279 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	AKR1	P39010	764 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	CAJ1	P39101	391 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	UFD2	P54860	961 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	ERF2	Q06551	359 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	PPM2	Q08282	695 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	MSH3	P25336	1018 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	ALG2	P43636	503 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUS1	YPL212C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5

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