RNA–Protein interactions for RNA: YML089C

YML089C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YML089C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YML089C	YML089C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	FOL1	P53848	824 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	ECM23	Q02710	187 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	SKG3	Q06315	1026 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	CSR2	Q12734	1121 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	VPS45	P38932	577 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	CSM2	P40465	213 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	GIN4	Q12263	1142 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	ERG12	P07277	443 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	DIT2	P21595	489 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	CHS3	P29465	1165 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	ACA1	P39970	489 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	YOR111W	Q99210	232 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YML089C	YML089C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	RFC5	P38251	354 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	DJP1	P40564	432 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	GDE1	Q02979	1223 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	YLR407W	Q06070	228 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	CIT1	P00890	479 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	NUC1	P08466	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	BDH2	P39713	417 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	UBP9	P39967	754 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	TPM2	P40414	161 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	LSB1	P53281	241 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	HST1	P53685	503 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	YPL150W	Q12152	901 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	CBP3	P21560	335 aa		11.25	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	YIL089W	P40500	205 aa		11.25	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	HRQ1	Q05549	1077 aa		11.25	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	ASF1	P32447	279 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	OCT1	P35999	772 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	RXT2	P38255	430 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	LYS14	P40971	790 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	SOL4	P53315	255 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	MDM1	Q01846	1127 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	CEX1	Q12453	761 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	TUS1	Q06412	1307 aa		11.24	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	PNT1	P38969	423 aa		11.23	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	DSE3	Q08729	430 aa		11.23	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	VAB2	P40003	282 aa		11.22	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	PCI8	P40512	444 aa		11.22	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	FAR11	P53917	953 aa		11.22	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	PEX29	Q03370	554 aa		11.22	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	MSP1	P28737	362 aa		11.21	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	SAS3	P34218	831 aa		11.21	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	MAL33	P38157	468 aa		11.21	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	PEX19	Q07418	342 aa		11.21	□□□□□ -0.61
YML089C	YML089C	GSC2	P40989	1895 aa		11.21	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	BSD2	P38356	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	RSM25	P40496	264 aa		11.2	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	KEX1	P09620	729 aa		11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	RDS1	P25611	832 aa		11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	PER1	P25625	357 aa		11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	MCD4	P36051	919 aa		11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.19	□□□□□ -0.62	not detected
YML089C	YML089C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	CSC1	Q06538	782 aa		11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.18	□□□□□ -0.62	not detected
YML089C	YML089C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	HAP5	Q02516	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	GIS4	Q04233	774 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	TIP41	Q12199	356 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	CDC6	P09119	513 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	RGP1	P16664	663 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	YML037C	Q03703	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	CSM3	Q04659	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YML089C	YML089C	FBP1	P09201	348 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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