RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	CSM2	P40465	213 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	BIK1	P11709	440 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	CBP3	P21560	335 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	MAL31	P38156	614 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	AKR1	P39010	764 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	HRQ1	Q05549	1077 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	VHR2	P40041	505 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	CHS3	P29465	1165 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	ASF1	P32447	279 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	BUD6	P41697	788 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	ENT3	P47160	408 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	PEX14	P53112	341 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	HST1	P53685	503 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	FOL1	P53848	824 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	NUC1	P08466	329 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	DIT2	P21595	489 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	SEC20	P28791	383 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	EPL1	P43572	832 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	VPS30	Q02948	557 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	YOR111W	Q99210	232 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	ACA1	P39970	489 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	YIL089W	P40500	205 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	FAR11	P53917	953 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	GDE1	Q02979	1223 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	ERG12	P07277	443 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	RXT2	P38255	430 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	HAP5	Q02516	242 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	SOL4	P53315	255 aa		6.52	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	MDM1	Q01846	1127 aa		6.52	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	DSE3	Q08729	430 aa		6.52	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	LAP2	Q10740	671 aa		6.52	□□□□□ -1.36
AMD1	YML035C	VPS45	P38932	577 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	GIN4	Q12263	1142 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	RFC5	P38251	354 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	CEX1	Q12453	761 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	KEX1	P09620	729 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	ACE2	P21192	770 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	MAL33	P38157	468 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	UBP9	P39967	754 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PCI8	P40512	444 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	RSC1	P53236	928 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PEX19	Q07418	342 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	AIM44	Q99299	758 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	CIT1	P00890	479 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	YGL138C	P53122	345 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PER1	P25625	357 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	ELM1	P32801	640 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	OCT1	P35999	772 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	MNN4	P36044	1178 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	DID4	P36108	232 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	RDS1	P25611	832 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	LYS14	P40971	790 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	COG8	Q04632	607 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	DCS2	Q12123	353 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	CDC6	P09119	513 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	MBR1	P23493	339 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PNT1	P38969	423 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	TPM2	P40414	161 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	CIR1	P42940	261 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	LSB1	P53281	241 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	CTR9	P89105	1077 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	SPT21	P35209	758 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	APC11	Q12157	165 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
AMD1	YML035C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.48	□□□□□ -1.37	not detected
AMD1	YML035C	VAB2	P40003	282 aa		6.48	□□□□□ -1.37

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