RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	FYV10	P40492	516 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	ATG2	P53855	1592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	CCP1	P00431	361 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	VMA3	P25515	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	RAD27	P26793	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	KAP122	P32767	1081 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	CEM1	P39525	442 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	DAK2	P43550	591 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	FOL1	P53848	824 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	VPS16	Q03308	798 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	BDF2	Q07442	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	RGP1	P16664	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	CAB3	P36076	571 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	MUM2	P38236	366 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	DYS1	P38791	387 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	MAD1	P40957	749 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	YJL049W	P47048	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	PEX8	P53248	589 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	RPO31	P04051	1460 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	FPS1	P23900	669 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	DPB3	P27344	201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SWI3	P32591	825 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	LDH1	P38139	375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	YGR035C	P53222	116 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SPO20	Q04359	397 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	PIN2	Q12057	282 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	NUP170	P38181	1502 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	MCM2	P29469	868 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	MET4	P32389	672 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	QDR1	P40475	563 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SPR3	P41901	512 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	YGR021W	P53212	290 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	ATG16	Q03818	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	HPF1	Q05164	967 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SRM1	P21827	482 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	RPB10	P22139	70 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	MRC1	P25588	1096 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	CDC11	P32458	415 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	TFC3	P34111	1160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	PES4	P39684	611 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	FIR1	P40020	876 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	NUP82	P40368	713 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	NUT2	Q06213	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	VPS5	Q92331	675 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	FRT1	Q99332	602 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	BPT1	P14772	1559 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	RPC31	P17890	251 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	YAP1801	P38856	637 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	VID27	P40157	782 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	HXT8	P40886	569 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	LYS5	P50113	272 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	PKH1	Q03407	766 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SPR28	Q04921	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SLX4	Q12098	748 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	FOB1	O13329	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	RAD4	P14736	754 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	TIM23	P32897	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	GIP1	P38229	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	PAF1	P38351	445 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	BSD2	P38356	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	APM2	P38700	605 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	HUL5	P53119	910 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	GRX3	Q03835	250 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	PPM2	Q08282	695 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	STH1	P32597	1359 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PAM18	YLR008C	PIF1	P07271	859 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAM18	YLR008C	MSN1	P22148	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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