RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W SHU2P38957 223 aa4.81□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W RSM26P47141 266 aa4.81□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W BUD9P53226 547 aa4.81□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W PEX13P80667 386 aa4.81□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W ELG1Q12050 791 aa4.81□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W PRY1P47032 299 aa4.8□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W FAR11P53917 953 aa4.8□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W GAS5Q08193 484 aa4.8□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W YIG1Q08956 461 aa4.8□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W MCD1Q12158 566 aa4.8□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W YPR053CQ6Q5F3 151 aa4.8□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W ERS1P17261 260 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W PRE9P23638 258 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W MSH3P25336 1018 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W SFA1P32771 386 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W EXO5P38289 585 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W PEX28P38848 579 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W YMR074CQ04773 145 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W YDR215CQ12240 137 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W YLL054CQ12244 843 aa4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W YCK2P23292 546 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W PIC2P40035 300 aa4.78□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W GCV1P48015 400 aa4.78□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W MEC3Q02574 474 aa4.78□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W RMD1Q03441 430 aa4.78□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPL17BYJL177W AI3P03877 415 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-DR6P0CX70 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-ER1P0CX71 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-LR2P0CX72 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-PLP0CX73 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-JR1P0CX74 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-LR3P0CX75 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-ML2P0CX76 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TAT1P38085 619 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W REI1P38344 393 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W KIP3P53086 805 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W YGL140CP53120 1219 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-GR1Q12085 440 aa4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W RSC6P25632 483 aa4.76□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W ARL1P38116 183 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W SKN7P38889 622 aa4.76□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W SLS1P42900 643 aa4.76□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W NEM1P38757 446 aa4.75□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W NCE103P53615 221 aa4.75□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W YOR223WQ12015 292 aa4.75□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W VMA4P22203 233 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W PAM1P37304 830 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W XKS1P42826 600 aa4.74□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W ARI1P53111 347 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W SVF1Q05515 481 aa4.74□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W HEM13P11353 328 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W SEC23P15303 768 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W RDH54P38086 958 aa4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W NOP7P53261 605 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W MTC5Q03897 1148 aa4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W AVO1Q08236 1176 aa4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W MCA1Q08601 432 aa4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W REC8Q12188 680 aa4.73□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data4.72□□□□□ -1.65not detected
RPL17BYJL177W GCR1P07261 785 aa4.72□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W TAF13P11747 167 aa4.72□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W NAP1P25293 417 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W PET112P33893 541 aa4.72□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W ATG14P38270 344 aa4.72□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W YGR045CP53229 120 aa4.72□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RPL17BYJL177W MNR2P35724 969 aa4.71□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W SPO74P45819 413 aa4.71□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W YPL034WQ03083 165 aa4.71□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W EST2Q06163 884 aa4.71□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W HDA2Q06629 674 aa4.71□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W MRL1Q06815 381 aa4.71□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W ADD66P36040 267 aa4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W GPT2P36148 743 aa4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W YAR028WP39548 234 aa4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W MAD1P40957 749 aa4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W CCT8P47079 568 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W YNR063WP53749 607 aa4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W GIC2Q06648 383 aa4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W RTT10Q08924 1013 aa4.7□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W DED1P06634 604 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W CLN2P20438 545 aa4.69□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W RAD27P26793 382 aa4.69□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W NAM7P30771 971 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W COQ2P32378 372 aa4.69□□□□□ -1.66
RPL17BYJL177W AKR1P39010 764 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43 ms