RNA–Protein interactions for RNA: YHL038C

CBP2, Required for splicing of the group I intron bI5 of the COB pre-mRNA, yeast

Gene CBP2, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP2	YHL038C	YJL049W	P47048	450 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	BSD2	P38356	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	AIM46	P38885	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	FLP1	P03870	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RNQ1	P25367	405 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	SFA1	P32771	386 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	PPG1	P32838	368 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	YAF9	P53930	226 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	IOC4	Q04213	475 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	TOS4	Q06266	489 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RNH70	P53331	553 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
CBP2	YHL038C	MON1	P53129	644 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RPC31	P17890	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	SPC42	P36094	363 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RRM3	P38766	723 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	DOS2	P54858	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
CBP2	YHL038C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	GIS4	Q04233	774 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	NSE3	Q05541	303 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	SQT1	P35184	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	IOC3	P43596	787 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	ULP1	Q02724	621 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	ADI1	Q03677	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	CDC34	P14682	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RSM26	P47141	266 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	NUT1	P53114	1132 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	RGP1	P16664	663 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PRI2	P20457	528 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	RAD27	P26793	382 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	UGA4	P32837	571 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	YIL165C	P40446	119 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PMT7	Q06644	662 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	INO80	P53115	1489 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	APM2	P38700	605 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	YGR130C	P53278	816 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	HEH2	Q03281	663 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PRK1	P40494	810 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	SKP1	P52286	194 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	CTR9	P89105	1077 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	MRL1	Q06815	381 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	CIT2	P08679	460 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	SAF1	P38352	637 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	ITC1	P53125	1264 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	RPN4	Q03465	531 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	OPI10	Q08202	246 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	GCR1	P07261	785 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	CHS2	P14180	963 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PIC2	P40035	300 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	TIM54	P47045	478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
CBP2	YHL038C	RSC2	Q06488	889 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	BDF2	Q07442	638 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	COB	P00163	385 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	RAD4	P14736	754 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	BAS1	P22035	811 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
CBP2	YHL038C	XKS1	P42826	600 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	HUL5	P53119	910 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	YGR053C	P53234	283 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	ALG12	P53730	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PEX13	P80667	386 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	RSC6	P25632	483 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PEX28	P38848	579 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	SHU2	P38957	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	PPT1	P53043	513 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	YNR040W	P53736	256 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	DUT1	P33317	147 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	DUR3	P33413	735 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	NIT1	P40447	199 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBP2	YHL038C	SAP155	P43612	1002 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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