RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W NEO1P40527 1151 aa5.86□□□□□ -1.47
SPT15YER148W NOP7P53261 605 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SPT15YER148W YIG1Q08956 461 aa5.86□□□□□ -1.47
SPT15YER148W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.86□□□□□ -1.47
SPT15YER148W POL5P39985 1022 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SPT15YER148W TED1P40533 473 aa5.85□□□□□ -1.47
SPT15YER148W YFL066CP43538 392 aa5.85□□□□□ -1.47
SPT15YER148W SAC7P17121 654 aa5.84□□□□□ -1.47
SPT15YER148W ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SPT15YER148W BOI2P39969 1040 aa5.84□□□□□ -1.47
SPT15YER148W YNR014WP53719 212 aa5.84□□□□□ -1.47
SPT15YER148W TAF13P11747 167 aa5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W SQT1P35184 431 aa5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W EXO5P38289 585 aa5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W PIC2P40035 300 aa5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W SBE2P42223 864 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W GCV1P48015 400 aa5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SPT15YER148W SEC23P15303 768 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SPT15YER148W MNR2P35724 969 aa5.82□□□□□ -1.48
SPT15YER148W RSM26P47141 266 aa5.82□□□□□ -1.48
SPT15YER148W DSE4P53753 1117 aa5.82□□□□□ -1.48
SPT15YER148W MSH3P25336 1018 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W PEP7P32609 515 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W YKL077WP36081 392 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W PEX28P38848 579 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W YGL140CP53120 1219 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W FAR11P53917 953 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W MEC3Q02574 474 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W THI72Q08579 599 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W ELG1Q12050 791 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W PHM7Q12252 991 aa5.81□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-DR6P0CX70 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-ER1P0CX71 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-LR2P0CX72 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-PLP0CX73 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-JR1P0CX74 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-LR3P0CX75 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-ML2P0CX76 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W VMA4P22203 233 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W SFA1P32771 386 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W MAE1P36013 669 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W RDH54P38086 958 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W RRM3P38766 723 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W NSG2P53898 299 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TDA6Q06466 467 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-GR1Q12085 440 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W YLL054CQ12244 843 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W PEP1P32319 1579 aa5.8□□□□□ -1.48
SPT15YER148W PET112P33893 541 aa5.79□□□□□ -1.48
SPT15YER148W ENT3P47160 408 aa5.79□□□□□ -1.48
SPT15YER148W BUD9P53226 547 aa5.79□□□□□ -1.48
SPT15YER148W PEX13P80667 386 aa5.79□□□□□ -1.48
SPT15YER148W CLN2P20438 545 aa5.78□□□□□ -1.48
SPT15YER148W SGS1P35187 1447 aa5.78□□□□□ -1.48
SPT15YER148W MET10P39692 1035 aa5.78□□□□□ -1.48
SPT15YER148W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SPT15YER148W BPT1P14772 1559 aa5.77□□□□□ -1.49
SPT15YER148W AI3P03877 415 aa5.77□□□□□ -1.49
SPT15YER148W ERS1P17261 260 aa5.77□□□□□ -1.49
SPT15YER148W MDJ1P35191 511 aa5.77□□□□□ -1.49
SPT15YER148W NEM1P38757 446 aa5.77□□□□□ -1.49
SPT15YER148W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SPT15YER148W PIN2Q12057 282 aa5.77□□□□□ -1.49
SPT15YER148W HEM13P11353 328 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SPT15YER148W ICP55P40051 511 aa5.76□□□□□ -1.49
SPT15YER148W XKS1P42826 600 aa5.76□□□□□ -1.49
SPT15YER148W GNP1P48813 663 aa5.76□□□□□ -1.49
SPT15YER148W VPS16Q03308 798 aa5.76□□□□□ -1.49
SPT15YER148W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SPT15YER148W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SPT15YER148W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data5.75□□□□□ -1.49not detected
SPT15YER148W REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SPT15YER148W SLS1P42900 643 aa5.75□□□□□ -1.49
SPT15YER148W SIW14P53965 281 aa5.75□□□□□ -1.49
SPT15YER148W RKM2Q03942 479 aa5.75□□□□□ -1.49
SPT15YER148W RTT10Q08924 1013 aa5.75□□□□□ -1.49
SPT15YER148W YOR223WQ12015 292 aa5.75□□□□□ -1.49
SPT15YER148W YDR215CQ12240 137 aa5.75□□□□□ -1.49
SPT15YER148W GCR1P07261 785 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W CDC34P14682 295 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W NCE103P53615 221 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W YMR187CQ03236 431 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W YMR074CQ04773 145 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W HDA2Q06629 674 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W HIR3P47171 1648 aa5.74□□□□□ -1.49
SPT15YER148W RSC6P25632 483 aa5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W DUT1P33317 147 aa5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W SKN7P38889 622 aa5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W HXT13P39924 564 aa5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W MAD1P40957 749 aa5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W HXT17P53631 564 aa5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W HXT15P54854 567 aa5.73□□□□□ -1.49
SPT15YER148W MRL1Q06815 381 aa5.73□□□□□ -1.49
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