RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 PEAK1Q9H792 1746 aa40.39■■■■■ 4.06
ACER3-214ENST00000534206 SOX12O15370 315 aa40.38■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 USP31Q70CQ4 1352 aa40.37■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa40.37■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.37■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 LRRC37A3O60309 1634 aa40.35■■■■■ 4.05
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ACER3-214ENST00000534206 USP54Q70EL1 1684 aa40.33■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 PARD3Q8TEW0 1356 aa40.33■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 RREB1Q92766 1687 aa40.32■■■■■ 4.05
ACER3-214ENST00000534206 NME9Q86XW9 330 aa40.32■■■■■ 4.05
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ACER3-214ENST00000534206 DDB1Q16531 1140 aa40.28■■■■■ 4.04
ACER3-214ENST00000534206 TMC1Q8TDI8 760 aa40.28■■■■■ 4.04
ACER3-214ENST00000534206 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
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ACER3-214ENST00000534206 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.26■■■■■ 4.04
ACER3-214ENST00000534206 NUP188Q5SRE5 1749 aa40.26■■■■■ 4.04
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ACER3-214ENST00000534206 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
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ACER3-214ENST00000534206 A0A1W2PP64 1363 aa40.23■■■■■ 4.03
ACER3-214ENST00000534206 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.23■■■■■ 4.03
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ACER3-214ENST00000534206 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.14■■■■■ 4.02
ACER3-214ENST00000534206 LTN1O94822 1766 aa40.14■■■■■ 4.02
ACER3-214ENST00000534206 ERBB3P21860 1342 aa40.14■■■■■ 4.02
ACER3-214ENST00000534206 CCDC7Q96M83 1385 aa40.13■■■■■ 4.02
ACER3-214ENST00000534206 PLSCR1O15162 318 aa40.13■■■■■ 4.01
ACER3-214ENST00000534206 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
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ACER3-214ENST00000534206 NBPF14Q5TI25 921 aa40.05■■■■■ 4
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ACER3-214ENST00000534206 HOXC9P31274 260 aa39.86■■■■□ 3.97
ACER3-214ENST00000534206 ACSBG1Q96GR2 724 aa39.86■■■■□ 3.97
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ACER3-214ENST00000534206 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
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ACER3-214ENST00000534206 GGNBP2Q9H3C7 697 aa39.8■■■■□ 3.96
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ACER3-214ENST00000534206 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.75■■■■□ 3.95
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ACER3-214ENST00000534206 MYOM1P52179 1685 aa39.7■■■■□ 3.95
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ACER3-214ENST00000534206 STK32BQ9NY57 414 aa39.68■■■■□ 3.94
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ACER3-214ENST00000534206 LRRC4BQ9NT99 713 aa39.67■■■■□ 3.94
ACER3-214ENST00000534206 ZBTB7AO95365 584 aa39.66■■■■□ 3.94
ACER3-214ENST00000534206 KIF20BQ96Q89 1820 aa39.64■■■■□ 3.94
ACER3-214ENST00000534206 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.64■■■■□ 3.94
ACER3-214ENST00000534206 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa39.62■■■■□ 3.93
ACER3-214ENST00000534206 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
ACER3-214ENST00000534206 USHBP1Q8N6Y0 703 aa39.6■■■■□ 3.93
ACER3-214ENST00000534206 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
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