RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP3K13O43283 966 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 FCHSD2O94868 740 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADGRB1O14514 1584 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PDE4CQ08493 712 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 RETREG2Q8NC44 543 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIF12Q96FN5 646 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 PANK3Q9H999 370 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLAIN2Q9P270 581 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTMR7Q9Y216 660 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 STRCQ7RTU9 1775 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 MS4A1P11836 297 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 CERKQ8TCT0 537 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 ORAI2Q96SN7 254 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFT172Q9UG01 1749 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.34□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHADLQ6NUI6 762 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 TECPR2O15040 1411 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC7Q96M83 1385 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 FOXO3O43524 673 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSME1Q06323 249 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 POM121Q96HA1 1249 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 IQGAP1P46940 1657 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 PIP4K2BP78356 416 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 DSG2Q14126 1118 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 OXER1Q8TDS5 423 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 DLC1Q96QB1 1528 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 MSH6P52701 1360 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACEP12821 1306 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTCH1Q13635 1447 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 TOM1O60784 492 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 OSBPP22059 807 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 FECHP22830 423 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 DIP2AQ14689 1571 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 FOXK1P85037 733 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 IRF5Q13568 498 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLCN1P35523 988 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 BRINP3Q76B58 766 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 FBXW7Q969H0 707 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 COG6Q9Y2V7 657 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.27□□□□□ -1.24
MSC-AS1-205ENST00000519068 LAMC1P11047 1609 aa7.27□□□□□ -1.25
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MSC-AS1-205ENST00000519068 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 FYB1O15117 783 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 BANK1Q8NDB2 785 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMC2Q8TDI7 906 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTGER2P43116 358 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP3K9P80192 1104 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.26□□□□□ -1.25
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