RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 ESPNB1AK53 854 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 ALG2Q9H553 416 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM187AA6NFU0 413 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 SOX11P35716 441 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 NNTQ13423 1086 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 NR5A1Q13285 461 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 LAPTM4AQ15012 233 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 HPS1Q92902 700 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 GLMNQ92990 594 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-410P-201ENST00000517006 AVPP01185 164 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF592Q92610 1267 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 UCN2Q96RP3 112 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 PIK3CDO00329 1044 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEMA3FQ13275 785 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 LCE2BO14633 110 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 DGAT1O75907 488 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAB15P59190 212 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 PKDCCQ504Y2 493 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 TIMP2P16035 220 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARID3CA6NKF2 412 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ITPKCQ96DU7 683 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 MYT1Q01538 1121 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF20Q5VTR2 975 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF135Q8IUD6 432 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-410P-201ENST00000517006 ST8SIA5O15466 376 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 LILRA1O75019 489 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCTRP47872 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 ERVK-9P63128 1117 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 Q6ZNB5 142 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC125Q86Z20 511 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CYLDQ9NQC7 956 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 AAASQ9NRG9 546 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CBLBQ13191 982 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 MEIOBQ8N635 442 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L5A8MUK1 530 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 SKIP12755 728 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 BMP1P13497 986 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 Q6ZVU0 165 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 AXIN1O15169 862 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP9BO43861 1147 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 DACH1Q9UI36 760 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L3A6NCW0 530 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L4A6NCW7 530 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADH1AP07327 375 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 NCOA4Q13772 614 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms