RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492076.1

SLC20A1-208, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC20A1, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-208ENST00000492076 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SLC20A1-208ENST00000492076 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.9□□□□□ -0.82
SLC20A1-208ENST00000492076 TET3O43151 1660 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 KCNA6P17658 529 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 NBR1Q14596 966 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 PACS2Q86VP3 889 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 UNC13BO14795 1591 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 MAP3K7O43318 606 aa9.87□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.87□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 E9PCH4 1651 aa9.87□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 C14orf37Q86TY3 774 aa9.86□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.86□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 NUP155O75694 1391 aa9.86□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 MSH6P52701 1360 aa9.86□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 ZFYVE9O95405 1425 aa9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 PPP4CP60510 307 aa9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 LAPTM4AQ15012 233 aa9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 ROCK1Q13464 1354 aa9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 NWD1Q149M9 1564 aa9.84□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 TSKSQ9UJT2 592 aa9.84□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.84□□□□□ -0.83
SLC20A1-208ENST00000492076 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.83□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 PDIA6Q15084 440 aa9.82□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 PHLPP1O60346 1717 aa9.82□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 SLAIN2Q9P270 581 aa9.81□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 TBX22Q9Y458 520 aa9.8□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.8□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 GFRA3O60609 400 aa9.79□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.79□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.79□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.79□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 TRPM2O94759 1503 aa9.78□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 SMAPO00193 183 aa9.78□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 ATF3P18847 181 aa9.78□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.78□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 DIP2AQ14689 1571 aa9.78□□□□□ -0.84
SLC20A1-208ENST00000492076 PRSS12P56730 875 aa9.77□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 POTEAQ6S8J7 498 aa9.77□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.77□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 TRIM52Q96A61 297 aa9.77□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 PTPRUQ92729 1446 aa9.76□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NBPF26B4DH59 902 aa9.76□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.76□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.76□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 JCADQ9P266 1359 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 CLTCL1P53675 1640 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 RNF40O75150 1001 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 MTRQ99707 1265 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 IL21Q9HBE4 155 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 PNMA3Q9UL41 463 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 PIK3R4Q99570 1358 aa9.75□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.74□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.74□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NAIPQ13075 1403 aa9.73□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.73□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 TATDN2Q93075 761 aa9.73□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 CFAP44Q96MT7 982 aa9.73□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 METP08581 1390 aa9.73□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.72□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.72□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.72□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 BRINP3Q76B58 766 aa9.72□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.72□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 KIF1BO60333 1816 aa9.72□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.72□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 LRP6O75581 1613 aa9.71□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
SLC20A1-208ENST00000492076 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SLC20A1-208ENST00000492076 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SLC20A1-208ENST00000492076 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SLC20A1-208ENST00000492076 LCE2BO14633 110 aa9.7□□□□□ -0.86
SLC20A1-208ENST00000492076 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.7□□□□□ -0.86
SLC20A1-208ENST00000492076 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SLC20A1-208ENST00000492076 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms