RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 ZNF428Q96B54 188 aa22.61■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.61■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.6■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.6■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.59■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.59■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 NUCB1Q02818 461 aa22.58■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 NME9Q86XW9 330 aa22.58■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 VAMP4O75379 141 aa22.57■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 IL13P35225 146 aa22.57■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 LNPKQ9C0E8 428 aa22.57■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 DDIT3P35638 169 aa22.56■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 MLECQ14165 292 aa22.56■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.56■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 AGLP35573 1532 aa22.55■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.55■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 GNAI1P63096 354 aa22.55■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 TSPYL6Q8N831 410 aa22.55■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 IFT57Q9NWB7 429 aa22.55■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.55■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 REREQ9P2R6 1566 aa22.54■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.53■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 MBIPQ9NS73 344 aa22.53■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.52■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 METP08581 1390 aa22.52■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 ZNF853P0CG23 659 aa22.52■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 HSCBQ8IWL3 235 aa22.52■■□□□ 1.2
SSR4-209ENST00000482902 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.51■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 PTCH1Q13635 1447 aa22.51■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.51■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 COG3Q96JB2 828 aa22.51■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 TPM2P07951 284 aa22.5■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.5■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 PIK3R4Q99570 1358 aa22.5■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.5■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.49■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.48■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 GCC1Q96CN9 775 aa22.48■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 DIP2BQ9P265 1576 aa22.48■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.48■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 CFAP44Q96MT7 982 aa22.47■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.47■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 ABCC4O15439 1325 aa22.46■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 CPS1P31327 1500 aa22.46■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.46■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.46■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 TSPOAP1O95153 1857 aa22.46■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SSR4-209ENST00000482902 FAM83GA6ND36 823 aa22.45■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 SNX21Q969T3 373 aa22.44■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.43■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 DCTN1Q14203 1278 aa22.42■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 SIRT1Q96EB6 747 aa22.42■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.42■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.41■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 GBP4Q96PP9 640 aa22.41■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.39■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 TECPR2O15040 1411 aa22.39■■□□□ 1.18
SSR4-209ENST00000482902 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.39■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.39■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.38■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.37■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.37■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.37■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.36■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 C3P01024 1663 aa22.36■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 PTMSP20962 102 aa22.36■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.36■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.35■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.34■■□□□ 1.17
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