RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFYVE9O95405 1425 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 IRF6O14896 467 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC34A2O95436 690 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 HIC1Q14526 733 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 MYOM2P54296 1465 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 ADGRB2O60241 1585 aa6.52□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 DISP2A7MBM2 1401 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 GNPATO15228 680 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC39A7Q92504 469 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC102AQ96A19 550 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SPON1Q9HCB6 807 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 RREB1Q92766 1687 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 EVI5O60447 810 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 FCHSD2O94868 740 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 ARXQ96QS3 562 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 NUTM2FA1L443 756 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D12O60347 775 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 C7P10643 843 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 PTGDRQ13258 359 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SLIT2O94813 1529 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 KANK1Q14678 1352 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SEC24BO95487 1268 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX12PQ92771 950 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 NOS1P29475 1434 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 USP32Q8NFA0 1604 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0G2JS52 829 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNQ2O43526 872 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 FECHP22830 423 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 MYT1Q01538 1121 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 IL27Q8NEV9 243 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM117AQ9C073 453 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP162Q5TB80 1403 aa6.47□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.46□□□□□ -1.37
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF14Q5TI25 921 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRUQ92729 1446 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 UTRNP46939 3433 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 ERBINQ96RT1 1412 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS72Q15906 364 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 GOPCQ9HD26 462 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 MYOM1P52179 1685 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 PHF14O94880 888 aa6.44□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEIP0CG38 1075 aa6.44□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.44□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 EPAS1Q99814 870 aa6.44□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 METRNQ9UJH8 293 aa6.44□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.44□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.43□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.43□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 PXDNQ92626 1479 aa6.43□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.43□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 ORAI2Q96SN7 254 aa6.43□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.43□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 CASZ1Q86V15 1759 aa6.43□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 NRAPQ86VF7 1730 aa6.42□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCA3Q99758 1704 aa6.42□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.42□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 ADGRL2O95490 1459 aa6.42□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 DLC1Q96QB1 1528 aa6.42□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF15Q9NS87 1388 aa6.42□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.41□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPA6P17066 643 aa6.41□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms