RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 CHRNA2Q15822 529 aa7.37□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 POLKQ9UBT6 870 aa7.37□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 DCTN1Q14203 1278 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 CCDC27Q2M243 656 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.36□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 IFT172Q9UG01 1749 aa7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 RIPK4P57078 832 aa7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.35□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 FAM83GA6ND36 823 aa7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 GOLGA2Q08379 1002 aa7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PHF20L1-211ENST00000460236 STRN4Q9NRL3 753 aa7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 APBB1O00213 710 aa7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 RUNDC1Q96C34 613 aa7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.33□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.32□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.32□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 MSH6P52701 1360 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 ADAMTS2O95450 1211 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 MCM10Q7L590 875 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 LAMC1P11047 1609 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.3□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 SLAIN2Q9P270 581 aa7.3□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.3□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 CPS1P31327 1500 aa7.3□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 BCAR3O75815 825 aa7.3□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.3□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 ATP7BP35670 1465 aa7.3□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 GCP02774 474 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 SIRT1Q96EB6 747 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 SLIT1O75093 1534 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.29□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 USP6P35125 1406 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 EVA1CP58658 441 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 MYOM1P52179 1685 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 EYA1Q99502 592 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.28□□□□□ -1.24
PHF20L1-211ENST00000460236 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 KRT24Q2M2I5 525 aa7.27□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 SGSM3Q96HU1 749 aa7.27□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 BRINP3Q76B58 766 aa7.27□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.27□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 IL13P35225 146 aa7.26□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 BRD1O95696 1058 aa7.26□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 HOXC9P31274 260 aa7.26□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 ANAPC15P60006 121 aa7.26□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 SKAP1Q86WV1 359 aa7.26□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 TECPR2O15040 1411 aa7.26□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 DIP2AQ14689 1571 aa7.26□□□□□ -1.25
PHF20L1-211ENST00000460236 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms