RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399201.5

SETD4-202, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-202ENST00000399201 NLRP6P59044 892 aa15.71■□□□□ 0.11
SETD4-202ENST00000399201 SLIT3O75094 1523 aa15.71■□□□□ 0.11
SETD4-202ENST00000399201 STK32BQ9NY57 414 aa15.7■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 USP6P35125 1406 aa15.69■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 MYOM1P52179 1685 aa15.69■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.68■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 BCL9O00512 1426 aa15.68■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 COL18A1P39060 1754 aa15.68■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 RGPD5Q99666 1765 aa15.68■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.68■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 PIK3C2AO00443 1686 aa15.67■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.67■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 CABP2Q9NPB3 220 aa15.67■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.67■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.65■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 ZBTB7AO95365 584 aa15.65■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 CABP1Q9NZU7 370 aa15.65■□□□□ 0.1
SETD4-202ENST00000399201 EXOC5O00471 708 aa15.64■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 EVC2Q86UK5 1308 aa15.64■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 ABCC6O95255 1503 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 CCDC7Q96M83 1385 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 SLC15A2Q16348 729 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 TXNRD1Q16881 649 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 MTFR1LQ9H019 292 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 NHSQ6T4R5 1651 aa15.63■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.61■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 TNS2Q63HR2 1409 aa15.6■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 PTGER2P43116 358 aa15.6■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.6■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 PROM2Q8N271 834 aa15.6■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 SYT17Q9BSW7 474 aa15.59■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.59■□□□□ 0.09
SETD4-202ENST00000399201 SOX12O15370 315 aa15.58■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.58■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.58■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 BTAF1O14981 1849 aa15.57■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 LTN1O94822 1766 aa15.57■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.56■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 ARXQ96QS3 562 aa15.56■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.56■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.55■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 NFAT5O94916 1531 aa15.55■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 MAP3K5Q99683 1374 aa15.55■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 UTRNP46939 3433 aa15.55■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 PAPPAQ13219 1627 aa15.54■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 IL2RBP14784 551 aa15.53■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 USP54Q70EL1 1684 aa15.53■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 POLD1P28340 1107 aa15.52■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 C1QTNF8P60827 252 aa15.52■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 GPR162Q16538 588 aa15.52■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.52■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.52■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.52■□□□□ 0.08
SETD4-202ENST00000399201 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.51■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 ERBB3P21860 1342 aa15.5■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.48■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 KLHL34Q8N239 644 aa15.48■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 USP31Q70CQ4 1352 aa15.48■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 ADRA2BP18089 450 aa15.47■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.47■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.46■□□□□ 0.07
SETD4-202ENST00000399201 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.45■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 ZNF827Q17R98 1081 aa15.44■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.44■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.44■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.44■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 LY75O60449 1722 aa15.43■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.43■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 GRIN3BO60391 1043 aa15.42■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 TMC1Q8TDI8 760 aa15.42■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 AKT1S1Q96B36 256 aa15.42■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.42■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 NME9Q86XW9 330 aa15.41■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.41■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.4■□□□□ 0.06
SETD4-202ENST00000399201 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.39■□□□□ 0.05
SETD4-202ENST00000399201 IP6K1Q92551 441 aa15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms