RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLIT1O75093 1534 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC24BO95487 1268 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM83GA6ND36 823 aa23.89■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DCTN1Q14203 1278 aa23.89■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
SH3BP1-201ENST00000357436 IL13P35225 146 aa23.89■■□□□ 1.41
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SH3BP1-201ENST00000357436 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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SH3BP1-201ENST00000357436 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM27P14373 513 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 FCHSD2O94868 740 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 USP6P35125 1406 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
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SH3BP1-201ENST00000357436 GSE1Q14687 1217 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1-201ENST00000357436 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
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SH3BP1-201ENST00000357436 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.78■■□□□ 1.4
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SH3BP1-201ENST00000357436 DIP2AQ14689 1571 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ABTB2Q8N961 1025 aa23.77■■□□□ 1.4
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SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF16BQ96L93 1317 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ITSN1Q15811 1721 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 NFE2L2Q16236 605 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PTCH1Q13635 1447 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPYL6Q8N831 410 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 IL27Q8NEV9 243 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ORAI2Q96SN7 254 aa23.75■■□□□ 1.39
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SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.74■■□□□ 1.39
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SH3BP1-201ENST00000357436 MCM10Q7L590 875 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT24Q2M2I5 525 aa23.72■■□□□ 1.39
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SH3BP1-201ENST00000357436 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF428Q96B54 188 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 AKAP12Q02952 1782 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SSH2Q76I76 1423 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MBIPQ9NS73 344 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PSME1Q06323 249 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.66■■□□□ 1.38
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SH3BP1-201ENST00000357436 VAMP4O75379 141 aa23.65■■□□□ 1.38
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SH3BP1-201ENST00000357436 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1-201ENST00000357436 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.64■■□□□ 1.38
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SH3BP1-201ENST00000357436 IFT57Q9NWB7 429 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PEAK1Q9H792 1746 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 GNAI1P63096 354 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NUCB1Q02818 461 aa23.62■■□□□ 1.37
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