RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 VAMP4O75379 141 aa24.61■■□□□ 1.53
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TM7SF3-201ENST00000343028 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.6■■□□□ 1.53
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TM7SF3-201ENST00000343028 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.59■■□□□ 1.53
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TM7SF3-201ENST00000343028 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.5■■□□□ 1.51
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TM7SF3-201ENST00000343028 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
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TM7SF3-201ENST00000343028 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.49■■□□□ 1.51
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TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF428Q96B54 188 aa24.42■■□□□ 1.5
TM7SF3-201ENST00000343028 BECN1Q14457 450 aa24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3-201ENST00000343028 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.41■■□□□ 1.5
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TM7SF3-201ENST00000343028 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.41■■□□□ 1.5
TM7SF3-201ENST00000343028 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.4■■□□□ 1.5
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TM7SF3-201ENST00000343028 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKHG5O94827 1062 aa24.38■■□□□ 1.49
TM7SF3-201ENST00000343028 AMPHP49418 695 aa24.38■■□□□ 1.49
TM7SF3-201ENST00000343028 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
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TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC4O15439 1325 aa24.38■■□□□ 1.49
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TM7SF3-201ENST00000343028 C14orf37Q86TY3 774 aa24.37■■□□□ 1.49
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TM7SF3-201ENST00000343028 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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