RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 ZBTB9Q96C00 473 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 TSPOAP1O95153 1857 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 NOS1P29475 1434 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 CAPN2P17655 700 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 POLD1P28340 1107 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 NLRP13Q86W25 1043 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.13□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 GLI2P10070 1586 aa6.12□□□□□ -1.43
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CLVS1-201ENST00000325897 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 MLECQ14165 292 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 MYOM2P54296 1465 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC66A2RUB6 948 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 DIP2BQ9P265 1576 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 RICTORQ6R327 1708 aa6.12□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 ERBB4Q15303 1308 aa6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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CLVS1-201ENST00000325897 DONSONQ9NYP3 566 aa6.11□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF853P0CG23 659 aa6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 IDI1Q13907 227 aa6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 ADGRB3O60242 1522 aa6.1□□□□□ -1.43
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CLVS1-201ENST00000325897 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 SCP2P22307 547 aa6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 NME8Q8N427 588 aa6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 KIF3AQ9Y496 699 aa6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.1□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.09□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 CTR9Q6PD62 1173 aa6.09□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 NBPF3Q9H094 633 aa6.09□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CLVS1-201ENST00000325897 MROH2AA6NES4 1674 aa6.09□□□□□ -1.43
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CLVS1-201ENST00000325897 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 PIK3C2GO75747 1445 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 BRD1O95696 1058 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL33A6NCF5 533 aa6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 UVSSAQ2YD98 709 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLVS1-201ENST00000325897 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
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CLVS1-201ENST00000325897 UQCRHP07919 91 aa6.07□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 TDO2P48775 406 aa6.07□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLVS1-201ENST00000325897 MNS1Q8NEH6 495 aa6.07□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 MED4Q9NPJ6 270 aa6.07□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 SYNMO15061 1565 aa6.07□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC189A1A4V9 331 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 NUDCQ9Y266 331 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 IFT172Q9UG01 1749 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 KIF3CO14782 793 aa6.06□□□□□ -1.44
CLVS1-201ENST00000325897 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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