RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ORAI2Q96SN7 254 aa28.5■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MST1RQ04912 1400 aa28.5■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.5■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFE2L2Q16236 605 aa28.49■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.48■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.48■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFAT5O94916 1531 aa28.48■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTN1O94822 1766 aa28.48■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF10O15013 1369 aa28.47■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOX12O15370 315 aa28.47■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTL1A6NKG5 1358 aa28.46■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATF3P18847 181 aa28.45■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMPHP49418 695 aa28.44■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.44■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLIN1O60240 522 aa28.43■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLIT3O75094 1523 aa28.42■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXO3O43524 673 aa28.42■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.42■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDRP35968 1356 aa28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALS2Q96Q42 1657 aa28.4■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.4■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXC9P31274 260 aa28.39■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.39■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSH6P52701 1360 aa28.39■■■□□ 2.14
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.39■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.39■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.39■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.36■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCAR3O75815 825 aa28.35■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.35■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP19O94966 1318 aa28.35■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.33■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRBNQ96SW2 442 aa28.32■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EYA1Q99502 592 aa28.32■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IP6K1Q92551 441 aa28.32■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT57Q9NWB7 429 aa28.29■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE3AQ14432 1141 aa28.28■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.28■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCP02774 474 aa28.27■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF853P0CG23 659 aa28.27■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNAI1P63096 354 aa28.27■■■□□ 2.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.26■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PXDNQ92626 1479 aa28.26■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.24■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP44Q96MT7 982 aa28.23■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF428Q96B54 188 aa28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.21■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.2■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM83GA6ND36 823 aa28.2■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.2■■■□□ 2.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.19■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.19■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.18■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCAPD2Q15021 1401 aa28.18■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MBIPQ9NS73 344 aa28.17■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRINP3Q76B58 766 aa28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC37A3O60309 1634 aa28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCTN1Q14203 1278 aa28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRB1P82279 1406 aa28.14■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.14■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCC6O95255 1503 aa28.14■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.14■■■□□ 2.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.14■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGPD5Q99666 1765 aa28.13■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLAIN2Q9P270 581 aa28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF4Q96M43 638 aa28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL18A1P39060 1754 aa28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHL1O00533 1208 aa28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM10Q7L590 875 aa28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MS4A1P11836 297 aa28.1■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AAMPQ13685 434 aa28.1■■■□□ 2.09
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms