RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.06■■□□□ 1.28
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USP48-201ENST00000308271 HS1BP3Q53T59 392 aa23■■□□□ 1.27
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USP48-201ENST00000308271 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.96■■□□□ 1.27
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USP48-201ENST00000308271 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.92■■□□□ 1.26
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USP48-201ENST00000308271 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.91■■□□□ 1.26
USP48-201ENST00000308271 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP48-201ENST00000308271 STK38Q15208 465 aa22.91■■□□□ 1.26
USP48-201ENST00000308271 PDILTQ8N807 584 aa22.91■■□□□ 1.26
USP48-201ENST00000308271 PZPP20742 1482 aa22.9■■□□□ 1.26
USP48-201ENST00000308271 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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