RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 NPATQ14207 1427 aa20.79■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 GORABQ5T7V8 394 aa20.79■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.78■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.78■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 PANK2Q9BZ23 570 aa20.77■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 ATP10AO60312 1499 aa20.77■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 RABEP1Q15276 862 aa20.76■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.76■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.75■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.74■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 GCC1Q96CN9 775 aa20.74■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.74■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 FAM83GA6ND36 823 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 NEO1Q92859 1461 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 SEC24BO95487 1268 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 KCNA6P17658 529 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 CLCN1P35523 988 aa20.73■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 HSPA2P54652 639 aa20.72■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.72■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.72■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.71■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.71■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.71■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 MBD3O95983 291 aa20.71■□□□□ 0.91
TRPC1-201ENST00000273482 NEK4P51957 841 aa20.7■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 GPATCH3Q96I76 525 aa20.7■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC1P33527 1531 aa20.7■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.7■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.7■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 PREX2Q70Z35 1606 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 POLKQ9UBT6 870 aa20.68■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.68■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PP64 1363 aa20.68■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.68■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.68■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 MPNDQ8N594 471 aa20.67■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 NSD2O96028 1365 aa20.67■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.67■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 UQCRHP07919 91 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 PIP4K2BP78356 416 aa20.66■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.65■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.65■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 ZMYND15Q9H091 742 aa20.65■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 PLA2R1Q13018 1463 aa20.65■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
TRPC1-201ENST00000273482 SSFA2P28290 1259 aa20.64■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 LTKP29376 864 aa20.64■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 TSPY26PQ9H489 355 aa20.63■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 TSPOAP1O95153 1857 aa20.63■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM27P14373 513 aa20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 MYL6BP14649 208 aa20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 CHRNA2Q15822 529 aa20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 BTBD11A6QL63 1104 aa20.62■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF592Q92610 1267 aa20.61■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.61■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 GNAI3P08754 354 aa20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 CABP4P57796 275 aa20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 TBX22Q9Y458 520 aa20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.59■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 TNNQ9UQP3 1299 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms