RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 NPATQ14207 1427 aa20.79■□□□□ 0.92
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TRPC1-201ENST00000273482 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.78■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.78■□□□□ 0.92
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TRPC1-201ENST00000273482 ATP10AO60312 1499 aa20.77■□□□□ 0.92
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TRPC1-201ENST00000273482 ZMYND15Q9H091 742 aa20.65■□□□□ 0.9
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TRPC1-201ENST00000273482 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 TBX22Q9Y458 520 aa20.6■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.59■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 TNNQ9UQP3 1299 aa20.59■□□□□ 0.89
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