RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 KLHL34Q8N239 644 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF592Q92610 1267 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 NFKBIBQ15653 356 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 ABCC11Q96J66 1382 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRE-201ENST00000254667 MRE11P49959 708 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRE-201ENST00000254667 MYL6BP14649 208 aa22.64■■□□□ 1.21
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PTPRE-201ENST00000254667 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRE-201ENST00000254667 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.61■■□□□ 1.21
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PTPRE-201ENST00000254667 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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PTPRE-201ENST00000254667 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRE-201ENST00000254667 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.58■■□□□ 1.21
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PTPRE-201ENST00000254667 EPS15P42566 896 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTPRE-201ENST00000254667 CCDC69A6NI79 296 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPRE-201ENST00000254667 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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PTPRE-201ENST00000254667 MNS1Q8NEH6 495 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRE-201ENST00000254667 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRE-201ENST00000254667 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 FIBPO43427 364 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 TRIM5Q9C035 493 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 NME9Q86XW9 330 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.5■■□□□ 1.19
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