RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.03■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 PEAK1Q9H792 1746 aa22.03■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 NEFMP07197 916 aa22.02■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 PRKAR2BP31323 418 aa22.02■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 AMPHP49418 695 aa22.02■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.02■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.01■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 HMOX1P09601 288 aa22■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.99■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 RTL1A6NKG5 1358 aa21.98■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 HOXC9P31274 260 aa21.97■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 RIPK4P57078 832 aa21.96■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.96■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 USP19O94966 1318 aa21.96■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 NFAT5O94916 1531 aa21.96■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.96■■□□□ 1.11
TVP23C-201ENST00000225576 SLIT3O75094 1523 aa21.95■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGEF10O15013 1369 aa21.95■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 NFE2L2Q16236 605 aa21.95■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 GCP02774 474 aa21.94■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.94■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 SLAIN2Q9P270 581 aa21.94■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.93■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 IL16Q14005 1332 aa21.93■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 IP6K1Q92551 441 aa21.93■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.92■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 BRINP3Q76B58 766 aa21.92■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.91■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.91■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 ALS2Q96Q42 1657 aa21.91■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.9■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 KDRP35968 1356 aa21.9■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 PXDNQ92626 1479 aa21.9■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.9■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 EYA1Q99502 592 aa21.9■■□□□ 1.1
TVP23C-201ENST00000225576 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.88■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.88■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.87■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 LTN1O94822 1766 aa21.85■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.83■■□□□ 1.09
TVP23C-201ENST00000225576 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.81■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.79■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 IFT57Q9NWB7 429 aa21.78■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHG5O94827 1062 aa21.77■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.77■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF853P0CG23 659 aa21.76■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 GNAI1P63096 354 aa21.76■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.76■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 NBPF4Q96M43 638 aa21.76■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 PLIN1O60240 522 aa21.75■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.75■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.75■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 NCAPD2Q15021 1401 aa21.74■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 CPDO75976 1380 aa21.74■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 BCAR3O75815 825 aa21.74■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 CFAP44Q96MT7 982 aa21.74■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 ABCC6O95255 1503 aa21.73■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 FAM83GA6ND36 823 aa21.73■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 ILDR2Q71H61 639 aa21.73■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.73■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.72■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.72■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.71■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 ERBB3P21860 1342 aa21.71■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 DCTN1Q14203 1278 aa21.7■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.7■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
TVP23C-201ENST00000225576 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.69■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF428Q96B54 188 aa21.69■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 MBIPQ9NS73 344 aa21.69■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 MCM10Q7L590 875 aa21.68■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.67■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.67■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 KIAA0232Q92628 1395 aa21.67■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 COL18A1P39060 1754 aa21.67■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 CRB1P82279 1406 aa21.66■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms