RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000196169.7

TDRD3-201, Transcript of tudor domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TDRD3, Length 3,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3-201ENST00000196169 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.73□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.73□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 MYOM2P54296 1465 aa14.73□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.72□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 SOX12O15370 315 aa14.72□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.72□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 MROH2AA6NES4 1674 aa14.72□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 OFD1O75665 1012 aa14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 TSC1Q92574 1164 aa14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 ATP7AQ04656 1500 aa14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 ADGRL1O94910 1474 aa14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 TET3O43151 1660 aa14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 SDSP20132 328 aa14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.71□□□□□ -0.05
TDRD3-201ENST00000196169 USP26Q9BXU7 913 aa14.71□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 POLKQ9UBT6 870 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 UQCRHP07919 91 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 IDI1Q13907 227 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 RABEP1Q15276 862 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 CDK19Q9BWU1 502 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.7□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 IL16Q14005 1332 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 FAM177BA6PVY3 158 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 NPATQ14207 1427 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.69□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 FCHSD2O94868 740 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 NEK4P51957 841 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 NFE2L2Q16236 605 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 TTC22Q5TAA0 569 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 RAPGEF3O95398 923 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 NUCB2P80303 420 aa14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 KIF1BO60333 1816 aa14.67□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 MEIS3Q99687 375 aa14.67□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 PTMSP20962 102 aa14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 NME9Q86XW9 330 aa14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 PLCB2Q00722 1185 aa14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 ST18O60284 1047 aa14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 ZNF445P59923 1031 aa14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 GNAI1P63096 354 aa14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 CHD1O14646 1710 aa14.65□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 F6X3S4 739 aa14.65□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 MCM10Q7L590 875 aa14.65□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 SHROOM2Q13796 1616 aa14.65□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 ADGRB1O14514 1584 aa14.65□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.65□□□□□ -0.06
TDRD3-201ENST00000196169 NSD2O96028 1365 aa14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 NUTM2FA1L443 756 aa14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 NECTIN2Q92692 538 aa14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 DCTPP1Q9H773 170 aa14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 ADGRB2O60241 1585 aa14.63□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 ABCC4O15439 1325 aa14.63□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.63□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 RILPL2Q969X0 211 aa14.63□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.62□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 PALD1Q9ULE6 856 aa14.62□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 CASC1Q6TDU7 716 aa14.62□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 TMX3Q96JJ7 454 aa14.62□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.62□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 CEP85Q6P2H3 762 aa14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 IFT57Q9NWB7 429 aa14.61□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.6□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.6□□□□□ -0.07
TDRD3-201ENST00000196169 DEPDC5O75140 1603 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms