RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NgefQ8CHT1 710 aa26.7■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MyclP10166 368 aa26.7■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mon2Q80TL7 1715 aa26.69■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vamp4O70480 141 aa26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cluap1Q8R3P7 413 aa26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf330Q922H9 316 aa26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sos1Q62245 1319 aa26.67■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AU019823E9PUQ3 292 aa26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3c2aQ61194 1686 aa26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubr1O70481 1757 aa26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6268A2A3U9 297 aa26.66■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Idi1P58044 227 aa26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3UPC7 1272 aa26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CemipQ8BI06 1361 aa26.65■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cabp2Q9JLK4 216 aa26.64■■□□□ 1.86
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scn7aB1AYL1 1681 aa26.64■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sox12Q04890 314 aa26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Topaz1E5FYH1 1653 aa26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10563F6WIE4 79 aa26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcm10Q0VBD2 885 aa26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map2P20357 1828 aa26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif4a2P10630 407 aa26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MvpQ9EQK5 861 aa26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col16a1Q8BLX7 1580 aa26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnmal2G3X9N3 661 aa26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmco5bQ80X59 307 aa26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl11aQ9QYE3 773 aa26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map7O88735 730 aa26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nectin2P32507 530 aa26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk31Q99MW1 1018 aa26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SkilQ60665 675 aa26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nutm1Q8BHP2 1126 aa26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slit2Q9R1B9 1521 aa26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd44B2RXR6 993 aa26.56■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp16Q99LG0 825 aa26.56■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MpripP97434 1024 aa26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tet3Q8BG87 1668 aa26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap3b2Q9JME5 1082 aa26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rabep1O35551 862 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wwc1Q5SXA9 1104 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn23Q6PB44 1692 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Camta1A2A891 1682 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sptbn5F6UCX4 1208 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plin1Q8CGN5 517 aa26.53■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Parp14Q2EMV9 1817 aa26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dennd6aQ8BH65 605 aa26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C3P01027 1663 aa26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif18aQ91WD7 886 aa26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa26.51■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlgn1Q99K10 843 aa26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FancaQ9JL70 1439 aa26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtprvP70289 1705 aa26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp777B9EKF4 885 aa26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpm3Q5F4S9 1721 aa26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col14a1Q80X19 1797 aa26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhdc4Q921I2 584 aa26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa26.45■■□□□ 1.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cabp4Q8VHC5 271 aa26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LifrP42703 1092 aa26.44■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cetn4Q8K4K1 168 aa26.44■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DaxxO35613 739 aa26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif24Q6NWW5 1356 aa26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ric3Q8BPM6 367 aa26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aldh1l2Q8K009 923 aa26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cog6Q8R3I3 657 aa26.41■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc35g1Q8BY79 368 aa26.39■■□□□ 1.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chl1P70232 1209 aa26.39■■□□□ 1.81
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alpk3Q924C5 1678 aa26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim27Q62158 513 aa26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdlim2Q8R1G6 349 aa26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms