RNA–Protein interactions for RNA: YNR063W

YNR063W, Transcript of Putative zinc-cluster protein of unknown function, yeast

Gene YNR063W, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR063W	YNR063W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	SPR3	P41901	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	ALD2	P47771	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	ECM23	Q02710	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	RGP1	P16664	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	CWH41	P53008	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	THI72	Q08579	599 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	TRS33	Q99394	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	CPS1	P27614	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	SRB8	P25648	1427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	MDJ1	P35191	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR063W	YNR063W	UBX7	P38349	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	HXT5	P38695	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	MTO1	P53070	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	YFL066C	P43538	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	YNR014W	P53719	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	KAP122	P32767	1081 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	MET1	P36150	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	HEH2	Q03281	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	PUP1	P25043	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	YAP3	P38749	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	MSC7	P38694	644 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	SKP1	P52286	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	TDA6	Q06466	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	SSM4	P40318	1319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	BOI2	P39969	1040 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	CAB1	Q04430	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	VMR1	P38735	1592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	SUV3	P32580	737 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	QDR2	P40474	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNR063W	YNR063W	USO1	P25386	1790 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	IML1	P47170	1584 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	RPC31	P17890	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	MAK10	Q02197	733 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	MRPL33	P20084	86 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	APM2	P38700	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	DYS1	P38791	387 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	PUN1	Q06991	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	RLF2	Q12495	606 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	YBR197C	P38306	217 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	SRS2	P12954	1174 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	VMA3	P25515	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	SKN7	P38889	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	PRK1	P40494	810 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	LDH1	P38139	375 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	IPL1	P38991	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	YML083C	Q04526	418 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	ISC10	P32645	267 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	NHA1	Q99271	985 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	GIP1	P38229	639 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	ALG14	P38242	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	YNR040W	P53736	256 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNR063W	YNR063W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	ITC1	P53125	1264 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	GCN2	P15442	1659 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	ISW1	P38144	1129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	IDI1	P15496	288 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	RRN6	P32786	894 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	YBR287W	P38355	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	BSD2	P38356	321 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	PNP1	Q05788	311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	RSC2	Q06488	889 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	PDR11	P40550	1411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
YNR063W	YNR063W	TAT1	P38085	619 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	GIS4	Q04233	774 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNR063W	YNR063W	THI12	P42883	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.2 ms