RNA–Protein interactions for RNA: YML112W

CTK3, Transcript of Gamma subunit of C-terminal domain kinase I, yeast

Gene CTK3, Length 891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTK3	YML112W	GIP2	P40036	548 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	ACF4	P47129	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	ATG1	P53104	897 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	TED1	P40533	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	GAS5	Q08193	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTK3	YML112W	GUP1	P53154	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	ALD3	P54114	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	UFD2	P54860	961 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	SOG2	Q08817	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	HAT1	Q12341	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	AI3	P03877	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	FUS1	P11710	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	SAC7	P17121	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	TFA2	P36145	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	RSC4	Q02206	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	TAF7	Q05021	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	SFA1	P32771	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	ERP5	P38819	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	MDJ2	P42834	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	LEM3	P42838	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	DSE4	P53753	1117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	YKR073C	P36153	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	PAN5	P38787	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	YNL011C	P53980	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	YJR124C	P47159	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	CTR9	P89105	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	MNL2	Q12205	849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	GLO4	Q12320	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	TRP3	P00937	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	RSC6	P25632	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	NEO1	P40527	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTK3	YML112W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	CDC55	Q00362	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	COB	P00163	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	BSC2	Q05611	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	NUT2	Q06213	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	AOS1	Q06624	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	FRT1	Q99332	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	DUR3	P33413	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	FET4	P40988	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	ELG1	Q12050	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	FLP1	P03870	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	NPR1	P22211	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	YHL008C	P38750	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	CTH1	P47976	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	COQ2	P32378	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	RIM11	P38615	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	YHL050C	P38721	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	YHR219W	P38900	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	REC8	Q12188	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	ERS1	P17261	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	LIP5	P32875	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	NCE103	P53615	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	FAR11	P53917	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTK3	YML112W	ELM1	P32801	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	KAE1	P36132	386 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	SAF1	P38352	637 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	SAM37	P50110	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	NUT1	P53114	1132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	AKR1	P39010	764 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
CTK3	YML112W	MED7	Q08278	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	CHS2	P14180	963 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	TOS1	P38288	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	SAP155	P43612	1002 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	PMT7	Q06644	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	MON1	P53129	644 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTK3	YML112W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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